Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P47768 Date Tue Jul 17 17:05:10 BST 2012 Unique Job ID a484637e4f5d2acd

Secondary structure and disorder prediction

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Sequence		M	A	G	Q	V	V	Q	Y	G	R	H	R	K	R	R	N	Y	A	R	I	S	E	V	L	E	L	P	N	L	I	E	I	Q	T	K	S	Y	E	W	F	L	R	E	G	L	I	E	M	F	R	D	I	S	P	I	E	D	F	T	G
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?			?		?	?																																										?		?
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Sequence		N	L	S	L	E	F	V	D	Y	R	L	G	E	P	K	Y	D	L	E	E	S	K	N	R	D	A	T	Y	A	A	P	L	R	V	K	V	R	L	I	I	K	E	T	G	E	V	K	E	Q	E	V	F	M	G	D	F	P	L	M	T
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Sequence		D	T	G	T	F	V	I	N	G	A	E	R	V	I	V	S	Q	L	V	R	S	P	S	V	Y	F	N	E	K	I	D	K	N	G	R	E	N	Y	D	A	T	I	I	P	N	R	G	A	W	L	E	Y	E	T	D	A	K	D	V	V
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Sequence		Y	V	R	I	D	R	T	R	K	L	P	L	T	V	L	L	R	A	L	G	F	S	S	D	Q	E	I	V	D	L	L	G	D	N	E	Y	L	R	N	T	L	E	K	D	G	T	E	N	T	E	Q	A	L	L	E	I	Y	E	R	L
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Disorder
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Sequence		R	P	G	E	P	P	T	V	E	N	A	K	S	L	L	Y	S	R	F	F	D	P	K	R	Y	D	L	A	S	V	G	R	Y	K	T	N	K	K	L	H	L	K	H	R	L	F	N	Q	K	L	A	E	P	I	V	N	T	E	T	G
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Sequence		E	I	V	V	E	E	G	T	V	L	D	R	R	K	I	D	E	I	M	D	V	L	E	S	N	A	N	S	E	V	F	E	L	H	G	S	V	I	D	E	P	V	E	I	Q	S	I	K	V	Y	V	P	N	D	D	E	G	R	T	T
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	V	I	G	N	A	F	P	D	S	E	V	K	C	I	T	P	A	D	I	I	A	S	M	S	Y	F	F	N	L	L	S	G	I	G	Y	T	D	D	I	D	H	L	G	N	R	R	L	R	S	V	G	E	L	L	Q	N	Q	F	R
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	G	L	S	R	M	E	R	V	V	R	E	R	M	S	I	Q	D	T	E	S	I	T	P	Q	Q	L	I	N	I	R	P	V	I	A	S	I	K	E	F	F	G	S	S	Q	L	S	Q	F	M	D	Q	A	N	P	L	A	E	L	T
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Sequence		H	K	R	R	L	S	A	L	G	P	G	G	L	T	R	E	R	A	Q	M	E	V	R	D	V	H	Y	S	H	Y	G	R	M	C	P	I	E	T	P	E	G	P	N	I	G	L	I	N	S	L	S	S	Y	A	R	V	N	E	F	G
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Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																														?				?	?	?
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Sequence		F	I	E	T	P	Y	R	K	V	D	L	D	T	H	A	I	T	D	Q	I	D	Y	L	T	A	D	E	E	D	S	Y	V	V	A	Q	A	N	S	K	L	D	E	N	G	R	F	M	D	D	E	V	V	C	R	F	R	G	N	N	T
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		V	M	A	K	E	K	M	D	Y	M	D	V	S	P	K	Q	V	V	S	A	A	T	A	C	I	P	F	L	E	N	D	D	S	N	R	A	L	M	G	A	N	M	Q	R	Q	A	V	P	L	M	N	P	E	A	P	F	V	G	T	G
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		M	E	H	V	A	A	R	D	S	G	A	A	I	T	A	K	H	R	G	R	V	E	H	V	E	S	N	E	I	L	V	R	R	L	V	E	E	N	G	V	E	H	E	G	E	L	D	R	Y	P	L	A	K	F	K	R	S	N	S	G
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Disorder																																					?	?	?	?	?	?	?	?								?			?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		T	C	Y	N	Q	R	P	I	V	A	V	G	D	V	V	E	Y	N	E	I	L	A	D	G	P	S	M	E	L	G	E	M	A	L	G	R	N	V	V	V	G	F	M	T	W	D	G	Y	N	Y	E	D	A	V	I	M	S	E	R	L
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		V	K	D	D	V	Y	T	S	I	H	I	E	E	Y	E	S	E	A	R	D	T	K	L	G	P	E	E	I	T	R	D	I	P	N	V	S	E	S	A	L	K	N	L	D	D	R	G	I	V	Y	I	G	A	E	V	K	D	G	D	I
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		L	V	G	K	V	T	P	K	G	V	T	E	L	T	A	E	E	R	L	L	H	A	I	F	G	E	K	A	R	E	V	R	D	T	S	L	R	V	P	H	G	A	G	G	I	V	L	D	V	K	V	F	N	R	E	E	G	D	D	T
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		L	S	P	G	V	N	Q	L	V	R	V	Y	I	V	Q	K	R	K	I	H	V	G	D	K	M	C	G	R	H	G	N	K	G	V	I	S	K	I	V	P	E	E	D	M	P	Y	L	P	D	G	R	P	I	D	I	M	L	N	P	L
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Sequence		G	V	P	S	R	M	N	I	G	Q	V	L	E	L	H	L	G	M	A	A	K	N	L	G	I	H	V	A	S	P	V	F	D	G	A	N	D	D	D	V	W	S	T	I	E	E	A	G	M	A	R	D	G	K	T	V	L	Y	D	G
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SS confidence
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Sequence		R	T	G	E	P	F	D	N	R	I	S	V	G	V	M	Y	M	L	K	L	A	H	M	V	D	D	K	L	H	A	R	S	T	G	P	Y	S	L	V	T	Q	Q	P	L	G	G	K	A	Q	F	G	G	Q	R	F	G	E	M	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		D	V	K	V	M	D	E	Q	D	N	E	I	E	M	T	D	V	D	D	D	D	V	V	E	R	K	V	D	L	Q	Q	N	D	A	P	E	T	Q	K	E	V	T	D
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Disorder								?		?				?	?			?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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