Job Description O33599 Confidence 100.00% Date Tue Jul 17 17:05:02 BST 2012 Rank 4 Aligned Residues 231 % Identity 96% Template d1qwya_ SCOP info Barrel-sandwich hybrid Duplicated hybrid motif Peptidoglycan hydrolase LytM Resolution 1.30

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		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Y	G	T	Y	Y	T	I	D	S	N	G	D	Y	H	H	T	P	D	G	N	W	N	Q	A	M	F	D	N	K	E	Y	S	Y	T	F	V	D	A	Q	G	H	T	H	Y	F	Y	N	C	Y	P	K	N	A	N	A	N	G	S	G	Q	T	Y	V	N	P	A	T	A	G	D	N	N	D	Y	T	A	S	Q	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	Y	G	T	Y	Y	T	I	D	S	N	G	D	Y	H	H	T	P	D	G	N	W	N	Q	A	M	F	D	N	K	E	Y	S	Y	T	F	V	D	A	Q	G	H	T	H	Y	F	Y	N	C	Y	P	K	N	A	N	A	N	G	S	G	Q	T	Y	V	N	P	A	T	A	G	D	N	N	D	Y	T	A	S	Q	S
Template Known Secondary structure			T	T	S						T	T	S						S	S	S									T	T									T	T	S						S	S				S	S		S	S								S			S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Q	H	I	N	Q	Y	G	Y	Q	S	N	V	G	P	D	A	S	Y	Y	S	H	S	N	N	N	Q	A	Y	N	S	H	D	G	N	G	K	V	N	Y	P	N	G	T	S	N	Q	N	G	G	S	A	S	K	A	T	A	S	G	H	A	K	D	A	S	W	L	T	S	R	K	Q	L	Q	P	Y	G	Q	Y	H
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	Q	H	I	N	Q	Y	G	Y	Q	S	N	V	G	P	D	A	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	S	G	H	A	K	D	A	S	W	L	T	S	R	K	Q	L	Q	P	Y	G	Q	Y	H
Template Known Secondary structure												S	S					G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T						S	S						T	S						S				T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.			240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.
Query SS confidence																																				.	.
Query Sequence		G	G	G	A	H	Y	G	V	D	Y	A	M	P	E	N	S	P	V	Y	S	L	T	D	G	T	V	V	Q	A	G	W	S	N	Y	.	.	G	G	G	N	Q	V	T	I	K	E	A	N	S	N	N	Y	Q	W	Y	M	H	N	N	R	L	T	V	S	A	G	D	K	V	K	A	G	D	Q	I	A	Y	S	G	S
Query Conservation																																				.	.
Alig confidence																																				.	.														.		.
Template Conservation																																																			.		.
Template Sequence		G	G	G	A	H	Y	G	V	D	Y	A	M	P	E	N	S	P	V	Y	S	L	T	D	G	T	V	V	Q	A	G	W	S	N	Y	G	G	G	N	Q	V	T	I	K	E	A	N	S	N	N	.	Y	.	Q	W	Y	M	H	N	N	R	L	T	V	S	A	G	D	K	V	K	A	G	D	Q	I	A	Y	S	G	S
Template Known Secondary structure		T	S	S				S							T	T						S	S	S										T	T	T	T									T	T	S	S		.		.							S						T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.		.
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.		.		.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	N	S	T	A	P	H	V	H	F	Q	R	M	S	G	G	I	G	N	Q	Y	A	V	D	P	T	S	Y	L	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	G	N	S	T	A	P	H	V	H	F	Q	R	M	S	G	G	I	G	N	Q	Y	A	V	D	P	T	S	Y	L	Q
Template Known Secondary structure			S	S		S	S	S									S			S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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