Job Description O06446 Confidence 99.25% Date Tue Jul 17 17:05:02 BST 2012 Rank 98 Aligned Residues 311 % Identity 18% Template c2w74B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:type i restriction enzyme ecor124ii r protein; PDBTitle: mutant (k220r) of the hsdr subunit of the ecor124i2 restriction enzyme in complex with atp Resolution 2.74 Å

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		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.			.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.
Query SS confidence																															.	.
Query Sequence		K	G	D	I	A	E	M	R	T	G	E	G	K	T	L	T	A	T	M	P	T	Y	L	N	A	L	A	G	R	.	.	G	V	H	V	I	T	V	N	E	Y	L	S	S	V	Q	S	E	E	M	A	E	L	Y	N	F	L	G	L	T	V	G	L	N	L	N	S	K	T	T	E	E	K	R	E	A	Y	A	Q	D
Query Conservation																															.	.
Alig confidence																															.	.																				.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.
Template Sequence		S	G	G	Y	I	W	H	T	T	G	S	G	K	T	L	T	S	F	K	A	A	R	L	A	T	E	L	D	F	I	D	K	V	F	F	V	V	D	R	K	D	L	D	Y	Q	T	M	K	E	Y	.	.	.	Q	R	F	S	P	D	S	V	N	G	S	E	N	T	A	G	L	K	R	N	L	D	K	D	D	N	K
Template Known Secondary structure		G	S							T	T	S	S													T	T		T	T										G	G	G										.	.	.		T	T	S	T	T			S	S	S										T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.
Template SS confidence
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350				.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	T	Y	S	T	N	N	E	L	G	F	D	Y	L	R	D	N	M	V	N	Y	S	E	D	R	V	M	R	P	L	H	F	A	I	I	D	E	V	D	S	I	L	I	D	E	A	R	T	P	L	I	I	S	G	E	A	E	K	S	T	S	L	Y	T	Q	A	N	V	F	A	K	M	L	K	Q	D	E	D	Y	K
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	I	V	T	T	I	Q	K	L	N	.	.	.	.	.	N	L	M	K	A	E	S	D	L	P	V	Y	N	Q	Q	V	V	F	I	F	D	E	C	H	R	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.							S			G	G	G	G	S								S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.						.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	D	E	K	T	K	A	V	H	L	T	E	Q	G	A	D	K	A	E	R	M	F	K	V	E	N	L	Y	D	V	Q	N	V	D	V	I	S	H	I	N	T	A	L	R	A	H	V	T	L	Q	R	D	V	D	Y	M	V	V	D	G	E	V	L	I	V	D	Q	F	T	G	R	T	M	P	G	R	R	F	S	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																															415	.	.
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	H	Q	A	I	E	A	K	E	G	V	Q	I	Q	N	E	S	K	T	M	A	S	I	T	F	Q	N	Y	F	R	M	Y	N	K	L	A	G	M	T	G	T	A	K	T	E	E	E	E	F	R	N	I	Y	N	M	T	V	T	Q	I	P	T	N	K	P	V	Q	R	N	D	K	S	D	L	I	Y	I	S	Q
Query Conservation
Alig confidence																																																																													.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.
Template Sequence		A	Q	K	N	L	K	K	K	F	K	R	Y	Y	Q	F	G	F	T	G	T	P	I	F	P	E	N	A	L	G	S	E	T	T	A	S	V	F	G	R	E	L	H	S	Y	V	I	T	D	A	I	R	D	E	K	V	L	K	F	K	V	D	Y	N	D	V	R	P	Q	F	K	S	L	E	T	E	.	.	.	R	I
Template Known Secondary structure											S									S	S				G	G	G		T	T	S									S													T	T	S	S												T	T	T	T	T	T	T			.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.
Template SS confidence
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.				.	.
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.												.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	K	F	D	A	V	V	E	D	V	V	E	K	H	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	P	V	L	L	G	T	V	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	S	E	Y	I	S	N	L	L	K	K
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	E	I	T	Q	Y	I	L	N	N	F	R	Q	K	T	H	R	T	F	P	G	S	K	G	F	N	A	M	L	A	V	S	S	V	D	A	A	K	A	Y	Y	A	T	F	K	P	L	R	I	A	T	I	F	S	F	A	G	E	I	S	D	E	T	F	D	T	A	K	E	F	L	D	A	A	I	R	E	Y	N	S
Template Known Secondary structure																	T			S	T	T											S	S																															S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.			.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.
Query SS confidence																													.	.
Query Sequence		R	G	I	R	H	D	V	L	N	A	K	N	H	E	R	E	A	E	I	V	A	G	A	G	Q	K	G	.	.	A	V	T	I	A	T	N	M	A	G	R	G	T	D	I	K	L	G	E	G	V	E	E	L	G	G	L	A	V	I	G	T	E	R	H	E	S	R	R	I	D	D	Q	L	R	G	R	S	G	R	Q
Query Conservation																													.	.
Alig confidence																													.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	F	K	T	N	F	S	T	D	S	N	G	F	Q	N	Y	Y	R	D	L	A	Q	R	V	K	N	Q	D	I	D	L	L	I	V	V	G	M	F	L	T	G	F	D	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	N	T	L	F	V	D	K	N	L	R	Y	H	G	L	M	Q	A	F	S	R	T	N	R	I
Template Known Secondary structure				T					S	S																	T	T	S	S	S					S	S	T	T	S	S	S				T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								S												G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		622	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.										.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.
		536	.	.	.	540	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	K	G	D	S	R	F	Y	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	D	A	T	K	T	F	G	N	I
Template Known Secondary structure				T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		693	.	.	.	.	.	.	700	.	.