Job Description O06446 Confidence 99.94% Date Tue Jul 17 17:05:02 BST 2012 Rank 21 Aligned Residues 358 % Identity 26% Template c1gl9B_ PDB info PDB header:topoisomerase Chain: B: PDB Molecule:reverse gyrase; PDBTitle: archaeoglobus fulgidus reverse gyrase complexed with adpnp Resolution 3.2 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.			.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.
Query SS confidence																																			.	.
Query Sequence		E	A	Y	A	L	V	R	E	G	S	K	R	V	F	N	M	T	P	Y	K	V	Q	I	M	G	G	I	A	I	H	K	G	D	.	.	I	A	E	M	R	T	G	E	G	K	T	L	T	A	T	M	P	T	Y	L	N	A	L	A	G	R	G	V	H	V	I	T	V	N	E	Y	L	S	S	V	Q	S	E	E	M
Query Conservation																																			.	.
Alig confidence																	.																		.	.
Template Conservation																	.
Template Sequence		F	L	L	K	E	F	V	E	F	F	R	K	C	V	G	.	E	P	R	A	I	Q	K	M	W	A	K	R	I	L	R	K	E	S	F	A	A	T	A	P	T	G	V	G	K	T	S	F	G	L	A	M	S	L	F	L	A	L	K	G	K	R	C	Y	V	I	F	P	T	S	L	L	V	I	Q	A	A	E	T	I
Template Known Secondary structure															T		.	S														T	T									B	T	S															T	T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure																	.
Template SS confidence
		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.		.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.					.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.					.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.																		.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.																		.	.	.	.
Query Sequence		A	E	L	Y	N	F	L	G	L	T	.	.	.	.	V	G	L	N	L	N	S	K	T	T	E	E	K	R	E	A	Y	.	.	.	.	A	Q	D	I	T	Y	S	T	N	N	E	L	G	F	D	Y	L	R	D	N	M	V	N	Y	S	E	D	R	V	M	R	P	L	H	F	A	I	I	D	E	V	D	S	I	L
Query Conservation												.	.	.	.																		.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.																		.	.	.	.												.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	K	Y	A	E	K	A	G	V	G	T	E	N	L	I	G	Y	Y	H	G	R	I	P	K	R	E	K	E	N	F	M	Q	N	L	R	N	F	K	I	V	I	T	T	T	Q	F	.	.	.	.	.	L	S	K	H	Y	R	E	.	.	.	.	.	.	L	G	H	F	D	F	I	F	V	D	D	V	D	A	I	L
Template Known Secondary structure						T	T	T					T	T	T						S												T	T	T	T	S		S									.	.	.	.	.					S	S	S	.	.	.	.	.	.	S				S					S		S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.						.	.	.	.	170	.	.							.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	E	A	R	T	P	L	I	I	S	G	E	A	E	K	S	T	S	L	Y	T	Q	A	N	V	F	A	K	M	L	K	Q	D	E	D	Y	K	Y	D	E	K	T	K	A	V	H	L	T	E	Q	G	A	D	K	A	E	R	M	F	K	V	E	N	L	Y	D	V	Q	N	V	D	V	I	S	H	I	N	T	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	S	K	N	V	D	K	L	L	H	L	L	G	F	H	Y	D	L	K	T	K	S	W	V	G	E	A	R	G	C	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S												T				B	T	T	T	T	B							S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	A	H	V	T	L	Q	R	D	V	D	Y	M	V	V	D	G	E	V	L	I	V	D	Q	F	T	G	R	T	M	P	G	R	R	F	S	E	G	L	H	Q	A	I	E	A	K	E	G	V	Q	I	Q	N	E	S	K	T	M	A	S	I	T	F	Q	N	Y	F	R	M	Y	N	K	L	A	G	M	T	G	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	V	S	T	A	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					B	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																												221	.	.	.	.	.
		380	.	.			.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.
Query SS confidence					.	.
Query Sequence		A	K	T	.	.	E	E	E	E	F	R	N	I	Y	N	M	T	V	T	Q	I	P	T	N	K	P	V	Q	R	N	D	K	S	D	L	I	Y	I	S	Q	K	G	K	F	D	A	V	V	E	D	V	V	E	K	H	K	A	G	Q	P	V	L	L	G	T	V	A	V	E	T	S	E	Y	I	S	N	L	L	K	K
Query Conservation					.	.
Alig confidence					.	.																												.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	K	K	G	K	K	A	E	L	F	R	Q	L	L	N	F	D	I	G	S	S	R	I	T	V	R	N	V	E	D	V	A	.	.	.	V	N	D	E	S	I	S	T	L	S	S	I	L	E	K	L	.	.	.	.	.	.	G	T	G	G	I	I	Y	A	R	T	G	E	E	A	E	E	I	Y	E	S	L	K	N
Template Known Secondary structure		S				T	T	T								S					B	S												.	.	.		S				T	T	T	T					T	T	S	.	.	.	.	.	.		S							S	S									T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.				.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.							.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.			.	.	.	.	.					490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.		.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520
Predicted Secondary structure																													.	.						.	.	.	.																.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.						.	.	.	.																.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	G	I	R	H	D	V	L	N	A	K	N	H	E	R	E	A	E	I	V	A	G	A	G	Q	K	G	.	.	A	V	T	I	A	.	.	.	.	T	N	M	A	G	R	G	T	D	I	K	L	G	E	G	.	V	E	E	L	G	G	L	A	V	I	G	T	E	R	H	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.						.	.	.	.																.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.																					.	.						.	.	.	.											.	.	.			.			.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.																																										.	.	.						.	.	.	.	.
Template Sequence		K	.	.	.	.	.	.	F	R	I	G	I	V	T	A	T	K	K	G	D	Y	E	K	F	V	E	G	E	I	D	H	L	I	G	T	A	H	Y	Y	G	T	L	V	R	G	L	D	L	.	.	.	P	E	R	I	R	.	.	.	.	.	F	A	V	F	V	G	C	P	S	F	R	V	T	I	E	D	I	D	S
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	S				B		S	S	S										T	T	S		S												T	G	G	G	T			.	.	.	T	T	T			.	.	.	.	.						S								T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.																																										.	.	.						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		298							.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.				340	.	.	.	.						.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
																																																															521	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.			.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	R	I	D	D	Q	L	R	G	R	S	G	R	.	.	Q	G	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	P	Q	M	V	K	L	L	A	Y	L	Y	R	N	V	D	E	I	E	R	L	L	P	A	V	E	R	H	I	D	E	V	R	E	I	L	K	K	V	M	G	K	E	R	P	Q	A	K	D	V	V	V	R	E	G	E	V	I	F	P	D	L	R	T	Y	I	Q	G	S	G	R	T	S	R	L	F	A	G	G
Template Known Secondary structure		S		G	G	G						S	S			T	T	T	T					S	S		S	T	T		S										S	S	S	S						S	S	S	B		S	S	S																T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
		538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.						.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	D	S	R	F	Y	L	S	L	Q	D	E	L	M	I	R	F	G	S	E	R	L	Q	K	M	M	S	R	L	G	L	D	D	S	T	.	.	.	.	.	P	I	E	S	K	M	V	S	R	A	V	E	S	A	Q	K	R	V
Query Conservation																																						.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	K	G	A	S	F	L	L	E	D	D	.	.	.	.	.	.	.	S	E	L	L	S	A	F	I	E	R	A	K	L	Y	D	I	E	F	K	S	I	D	E	V	D	F	E	K	L	S	R	E	L	D	E	S	R	D	R	Y
Template Known Secondary structure												S		.	.	.	.	.	.	.													T	T	S	S						S		S		T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.								.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.