Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P52078 Date Tue Jul 17 17:05:11 BST 2012 Unique Job ID 91020c197ee4e477

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	K	F	L	K	Y	F	L	I	L	L	A	L	V	L	I	V	V	P	I	V	F	A	T	L	L	F	K	T	S	Q	D	A	F	E	S	S	Q	D	S	K	N	A	N	R	Q	S	N	L	R	D	N	K	V	N	P	E	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	I	S	I	L	F	L	G	I	D	D	N	D	G	R	R	K	K	G	Q	D	A	E	H	S	R	S	D	A	M	I	L	T	T	F	N	Q	S	K	H	Q	I	R	M	L	S	I	P	R	D	T	I	S	Y	I	P	K	V	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	D	K	I	T	H	A	H	A	Y	G	G	P	I	A	A	M	D	S	V	E	A	T	M	N	V	P	V	D	Y	Y	V	R	V	N	M	K	A	F	V	E	A	V	N	E	L	G	G	I	Y	Y	D	V	P	Y	D	L	N	E	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	T	D	D	T	G	K	I	K	I	K	K	G	Y	Q	K	L	N	G	D	E	A	L	A	V	A	R	T	R	H	H	D	S	D	L	K	R	G	Q	R	Q	M	E	L	I	K	I	L	F	Q	K	A	Q	E	V	D	S	I	D	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?																				?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	D	N	V	I	Q	I	V	G	K	N	A	K	H	N	L	T	N	S	E	I	K	A	L	A	K	M	Y	L	T	N	D	V	E	I	K	T	A	Q	L	K	G	K	D	D	M	L	N	G	I	Y	Y	Y	H	P	S	V	E	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?		?															?	?	?	?	?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	K	Y	A	N	L	L	R	K	D	L	E	L	S	P	I	N	D	K	N	D	F	L	D	Q	R	V	I	N	H	Y	G	S	L	I	P	L	T	P	L	D	N	S	L	L	R	K	E	Q	N	D	T	T	D	K	D	K	T	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Sequence		E	N	S	D	S	T	N	N	S	D	S	S	N	Q	Q	Q	P	A	T	D	Q	N	S	N	Q	N	Q	G	G	T	Q	Q	A	P	Q	A	S	N	N	Q	N	G	V	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand