Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description O50581 Date Tue Jul 17 17:05:03 BST 2012 Unique Job ID 724779a218884589

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	K	V	N	L	I	E	S	P	Y	S	L	L	Q	L	K	G	I	G	P	K	K	I	E	V	L	Q	Q	L	N	I	H	T	V	E	D	L	V	L	Y	L	P	T	R	Y	E	D	N	T	V	I	D	L	N	Q	A	E	D	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	N	V	T	I	E	G	Q	V	Y	T	A	P	V	V	A	F	F	G	R	N	K	S	K	L	T	V	H	L	M	V	N	N	I	A	V	K	C	I	F	F	N	Q	P	Y	L	K	K	K	I	E	L	N	Q	T	I	T	V	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	W	N	R	V	K	Q	E	I	T	G	N	R	V	F	F	N	S	Q	G	T	Q	T	Q	E	N	A	D	V	Q	L	E	P	V	Y	R	I	K	E	G	I	K	Q	K	Q	I	R	D	Q	I	R	Q	A	L	N	D	V	T	I	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?			?		?			?		?		?		?	?	?	?	?	?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	W	L	T	D	E	L	R	E	K	Y	K	L	E	T	L	D	F	T	L	N	T	L	H	H	P	K	S	K	E	D	L	L	R	A	R	R	T	Y	A	F	T	E	L	F	L	F	E	L	R	M	Q	W	L	N	R	L	E	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	D	E	A	I	E	I	D	Y	D	I	D	Q	V	K	S	F	I	D	R	L	P	F	E	L	T	E	A	Q	K	S	S	V	N	E	I	F	R	D	L	K	A	P	I	R	M	H	R	L	L	Q	G	D	V	G	S	G	K	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																					?																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	A	A	I	C	M	Y	A	L	K	T	A	G	Y	Q	S	A	L	M	V	P	T	E	I	L	A	E	Q	H	A	E	S	L	M	A	L	F	G	D	S	M	N	V	A	L	L	T	G	S	V	K	G	K	K	R	K	I	L	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	L	E	N	G	T	I	D	C	L	I	G	T	H	A	L	I	Q	D	D	V	I	F	H	N	V	G	L	V	I	T	D	E	Q	H	R	F	G	V	N	Q	R	Q	L	L	R	E	K	G	A	M	T	N	V	L	F	M	T	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	I	P	R	T	L	A	I	S	V	F	G	E	M	D	V	S	S	I	K	Q	L	P	K	G	R	K	P	I	I	T	T	W	A	K	H	E	Q	Y	D	K	V	L	M	Q	M	T	S	E	L	K	K	G	R	Q	A	Y	V	I	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		P	L	I	E	S	S	E	H	L	E	D	V	Q	N	V	V	A	L	Y	E	S	L	Q	Q	Y	Y	G	V	S	R	V	G	L	L	H	G	K	L	S	A	D	E	K	D	E	V	M	Q	K	F	S	N	H	E	I	N	V	L	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	T	V	V	E	V	G	V	N	V	P	N	A	T	F	M	M	I	Y	D	A	D	R	F	G	L	S	T	L	H	Q	L	R	G	R	V	G	R	S	D	Q	Q	S	Y	C	V	L	I	A	S	P	K	T	E	T	G	I	E	R	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		T	I	M	T	Q	T	T	D	G	F	E	L	S	E	R	D	L	E	M	R	G	P	G	D	F	F	G	V	K	Q	S	G	L	P	D	F	L	V	A	N	L	V	E	D	Y	R	M	L	E	V	A	R	D	E	A	A	E	L	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?			?																	?			?		?																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.
Sequence		S	G	V	F	F	E	N	T	Y	Q	H	L	R	H	F	V	E	E	N	L	L	H	R	S	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand