Job Description O50581 Confidence 99.93% Date Tue Jul 17 17:05:03 BST 2012 Rank 60 Aligned Residues 315 % Identity 21% Template c2w00B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:hsdr; PDBTitle: crystal structure of the hsdr subunit of the ecor124i2 restriction enzyme in complex with atp Resolution 2.6 Å

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		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.									.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.			.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Query Sequence		L	T	E	A	Q	K	S	S	V	N	E	I	F	R	D	L	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	R	M	H	R	L	L	Q	G	D	V	G	S	G	K	T	V	V	A	A	I	C	M	Y	A	L	K	T	A	G	Y	.	.	Q	S	A	L	M	V	P	T	E	I	L	A	E	Q	H	A	E	S	L	M
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		X	R	P	Y	Q	I	A	A	T	E	R	I	L	W	K	I	K	S	S	F	T	A	K	N	W	S	K	P	E	S	G	G	Y	I	W	H	T	T	G	S	G	K	T	L	T	S	F	K	A	A	R	L	A	T	E	L	D	F	I	D	K	V	F	F	V	V	D	R	K	D	L	D	Y	Q	T	X	K	E	Y	Q
Template Known Secondary structure																							T	T			S	S	G	G	G	S							T	T	S	S													T	T		T	T										G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.								.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.																				.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.																				.
Query Sequence		A	L	F	G	D	S	M	N	V	A	L	L	T	G	S	V	K	G	K	K	R	K	I	L	L	E	Q	L	E	N	G	T	I	D	C	L	I	G	T	H	A	L	I	Q	D	D	V	I	.	.	.	.	.	.	.	F	H	N	V	G	L	V	I	T	D	E	Q	H	R	F	G	V	N	Q	.	R	Q	L	L	R
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.																				.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	F	S	P	D	S	V	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	S	E	N	T	A	G	L	K	R	N	L	D	K	D	D	N	K	I	I	V	T	T	I	Q	K	L	N	N	L	X	K	A	E	S	D	L	P	V	Y	N	Q	Q	V	V	F	I	F	D	E	C	H	R	S	Q	F	G	E	A	Q	K	N	L	K
Template Known Secondary structure		T	T	S	T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S													S	S																						G	G	G	G	S								S			T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.									.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.								.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	K	G	A	M	T	N	V	L	F	M	T	A	T	P	I	P	R	T	.	.	.	.	.	.	.	L	A	I	S	V	F	G	E	M	D	V	S	S	I	K	Q	L	P	K	G	R	K	P	I	I	T	T	W	A	K	H	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	K	F	K	R	Y	Y	Q	F	G	F	T	G	T	P	I	F	P	E	N	A	L	G	S	E	T	T	A	S	V	F	G	R	E	L	H	S	Y	V	I	T	D	A	I	R	D	E	K	V	L	K	F	K	V	D	Y	N	D	V	R	P	Q	F	K	S	L	E	T	E	T	D	E	K	K	L	S	A	A	E	N
Template Known Secondary structure					S									S	S				S	T	T		T	T	S									S														T	S	S												T	T	T					T										T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
										458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.											.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Y	D	K	V	L	M	Q	M	T	S	E	L	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	Q	A	Y	V	I	C	P	L	I	E	S	S	E	H	L	E	D	V	Q	N	V	V	A	L	Y	E	S	L	Q	Q	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	Q	A	F	L	H	P	X	R	I	Q	E	I	T	Q	Y	I	L	N	N	F	R	Q	K	T	H	R	T	F	P	G	S	K	G	F	N	A	X	L	A	V	S	S	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	K	A	Y	Y	A	T	F	K	R	L	Q	E	E	A	A	N	K	S	A	T	Y	K	P	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T																					T			S	S	S											S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.																				S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.										.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	G	L	L	H	G	K	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	E	K	D	E	V	M	Q	K	F	S	N	H	E	I	N	V	L	V	S	T	T	V	V	E
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	I	A	T	I	F	S	F	A	A	I	G	E	I	S	D	E	T	F	D	T	S	A	X	D	S	S	A	K	E	F	L	D	A	A	I	R	E	Y	N	S	H	F	K	T	N	F	S	T	D	S	N	G	F	Q	N	Y	Y	R	D	L	A	Q	R	V	K	N	Q	D	I	D	L	L	I	V	V	G	X	F	L
Template Known Secondary structure																				S		G	G	G	S																				T					S	S																	T	T	S	S	S					S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.
		546	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.			.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.
Query SS confidence																																			.	.
Query Sequence		V	G	V	N	V	P	N	A	T	F	M	M	I	Y	D	A	D	R	F	G	L	S	T	L	H	Q	L	R	G	R	V	G	R	.	.	S	D	Q	Q	S	Y	C	V	L	I	A	S	P	K	T	E	T	G	I	E
Query Conservation																																			.	.
Alig confidence																			.	.															.	.
Template Conservation																			.	.
Template Sequence		T	G	F	D	A	P	T	L	N	T	L	F	V	D	K	N	L	.	.	R	Y	H	G	L	X	Q	A	F	S	R	T	N	R	I	Y	D	A	T	K	T	F	G	N	I	V	T	F	R	D	L	E	R	S	T	I
Template Known Secondary structure		S	S				T	T								S			.	.										G	G	G						T	T			S						S	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.
Template SS confidence
		661	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.			.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.