Job Description O52582 Confidence 99.81% Date Tue Jul 17 17:05:03 BST 2012 Rank 121 Aligned Residues 296 % Identity 16% Template c3uoyB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:otemo; PDBTitle: crystal structure of otemo complex with fad and nadp (form 1) Resolution 2.00 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	I	V	V	V	G	A	V	A	G	G	A	T	C	A	S	Q	I	R	R	L	D	K	E	S	D	I	I	I	F	E	K	D	R	D	M	S	F	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	A	L	P	Y	V	I	G	E	V	V	E	D	R	R	Y	A
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.
Template Sequence		D	A	V	V	I	G	A	G	V	T	G	I	Y	Q	A	F	L	I	N	Q	A	.	.	G	M	K	V	L	G	I	E	A	G	E	D	V	G	G	T	W	Y	W	N	R	Y	P	G	C	R	L	D	T	E	S	Y	A	Y	G	Y	F	A	L	K	G	I	I	P	E	W	E	W	S	E	N	F	A	S	Q	P	E
Template Known Secondary structure									S													T	.	.	T								S	S	S	S	S		T								T	T		B		S	S											T	T	S	S	T	T				S	B	S	S		B
Template Predicted Secondary structure																							.	.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.			.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.			.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.			.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.																																											.	.
Query SS confidence																.	.																																											.	.
Query Sequence		L	A	Y	T	P	E	K	F	Y	D	R	K	Q	I	.	.	T	V	K	T	Y	H	E	V	I	A	I	N	D	E	R	Q	T	V	S	V	L	N	R	K	T	N	E	Q	F	E	E	S	Y	D	K	L	I	L	S	P	G	A	.	.	S	A	N	S	L	G	F	E	S	D	I	T	F	T	L	R	N	L	E	D
Query Conservation																.	.																																											.	.
Alig confidence																.	.																												.															.	.
Template Conservation																																													.
Template Sequence		M	L	R	Y	V	N	R	A	A	D	A	M	D	V	R	K	H	Y	R	F	N	T	R	V	T	A	A	R	Y	V	E	N	D	R	L	W	E	V	T	L	D	N	E	.	E	V	V	T	C	R	F	L	I	S	A	T	G	P	L	S	A	S	R	M	P	D	I	K	G	I	D	S	F	K	G	E	S	F	H	S
Template Known Secondary structure														T		G	G	G				S										T	T	T	T							T	T	T	.														S	S		S	B						T	T	G	G	G			S					G
Template Predicted Secondary structure																																													.
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.					.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	D	A	I	D	Q	F	I	K	A	N	.	.	.	.	Q	V	D	K	V	L	V	V	G	A	G	Y	V	S	L	E	V	L	E	N	L	N	E	R	G	L	H	P	T	L	I	H	R	S	D	K	I	N	K	L	M	D	A	D	M	N	Q	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	R	W	P	T	D	A	G	A	P	K	G	V	D	F	T	G	K	R	V	G	V	I	G	T	G	A	T	G	V	Q	I	I	P	I	A	A	E	T	A	K	E	L	Y	V	F	Q	R	T	P	N	W	C	T	P	L	G	N	S	P	M	S	K	E	K	M	D	S	L	R	N	R	Y	P	T	I	L	E	Y	V
Template Known Secondary structure		G	G			B					B		S				B	T									S														B	S							S	S											B												T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	S	T	D	T	A	F	P	Y	H	R	D	P	R	K	G	T	D	V	S	E	S	E	R	D	A	F	F	E	E	L	Y	R	Q	P	G	Y	G	I	W	L	S	G	F	R	D	L	L	L	N	K	E	S	N	K	F	L	A	D	F	V	A	K	K	I	R	Q	R	V	K	D	P	V	V	A	E	K	L	I	P
Template Known Secondary structure		T	T	S	S	S	S	S	S				B	S	S		T	T	S	S															S	S	S	T					T	S	B	T	T	T	T	T																					S	S							T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
																	195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.			.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240					.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																																	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																																	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	D	E	L	D	K	R	E	I	P	Y	R	L	.	.	N	E	E	I	N	A	I	N	G	N	E	I	T	F	K	S	G	K	V	E	H	Y	D	M	I	I	E	G	V	G	T	H	.	.	.	.	P	N	S	K	F	I	E	S	S	N	I	K	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																																	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																		.															.	.	.	.
Template Conservation																																																		.
Template Sequence		K	D	H	P	F	G	A	K	R	V	P	M	E	T	N	Y	Y	E	T	Y	N	R	D	N	V	H	L	V	D	I	R	E	A	P	I	Q	E	V	T	P	E	G	I	K	T	A	D	A	.	A	Y	D	L	D	V	I	I	Y	A	T	G	F	D	A	G	S	L	D	R	I	D	I	R	G	K	D	N	V	R	L
Template Known Secondary structure		S	S	S		T	T	S	S						S	S					T	T	S	T	T						T	T	T	S							S	S					S	S		.					S								B				T	T	T	T	S					G	G	G		B
Template Predicted Secondary structure																																																		.
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.		.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.				.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.
Query SS confidence															.	.	.
Query Sequence		D	R	K	G	F	I	P	V	N	D	K	F	E	.	.	.	T	N	V	P	N	I	Y	A	I	G	D	I	A	T	S	H	Y	R	H	V	D	L	P	A	S	V	P	L	A	W	G	A	H	R	A	A	S	I	V	A	E	Q	I
Query Conservation															.	.	.
Alig confidence															.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	A	W	A	E	G	P	S	T	Y	L	G	L	Q	A	R	G	F	P	N	F	F	T	L	V	G	P	H	N	G	S	T	F	C	N	.	.	.	.	.	.	.	V	G	V	C	G	G	L	Q	A	E	W	V	L	R	M	I
Template Known Secondary structure					T	T	T	S				B	T	T	T	B		T	T		T	T					S		G	G	G	T	G	G	G	S		.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.								.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.