Job Description O52582 Confidence 99.81% Date Tue Jul 17 17:05:03 BST 2012 Rank 120 Aligned Residues 295 % Identity 16% Template c3gwdA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:cyclohexanone monooxygenase; PDBTitle: closed crystal structure of cyclohexanone monooxygenase Resolution 2.30 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.										.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.															.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	I	V	V	V	G	A	V	A	G	G	A	T	C	A	S	Q	I	R	R	L	D	K	E	S	D	I	I	I	F	E	K	D	R	D	M	S	F	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	A	L	P	Y	V	I	G	E	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	R	R	Y	A
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.
Template Sequence		D	A	V	V	I	G	A	G	F	G	G	I	Y	A	V	H	K	L	H	H	E	L	.	G	L	T	T	V	G	F	D	K	A	D	G	P	G	G	T	W	Y	W	N	R	Y	P	G	A	L	S	D	T	E	S	H	L	Y	R	F	S	F	D	R	D	L	L	Q	E	S	T	W	K	T	T	Y	I	T	Q	P	E
Template Known Secondary structure									S													T	S	.									S	S	S	S	S		T								T	T							T	T	T	S	S			S											S	B	S
Template Predicted Secondary structure																								.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.		.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.			.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.
Query SS confidence																	.	.
Query Sequence		L	A	Y	T	P	E	K	F	Y	D	R	K	Q	I	T	.	.	V	K	T	Y	H	E	V	I	A	I	N	D	E	R	Q	T	V	S	V	L	N	R	K	T	N	E	Q	F	E	E	S	Y	D	K	L	I	L	S	P	G	A	S	A	N	S	L	G	F	E	S	D	I	T	F	T	L	R	N	L	E	D	T	D
Query Conservation																	.	.
Alig confidence																	.	.																					.
Template Conservation																																							.
Template Sequence		I	L	E	Y	L	E	D	V	V	D	R	F	D	L	R	R	H	F	K	F	G	T	E	V	T	S	A	L	Y	L	D	D	E	N	L	W	E	.	V	T	T	D	H	G	E	V	Y	R	A	K	Y	V	V	N	A	V	G	L	L	S	A	I	N	F	P	N	L	P	G	L	D	T	F	E	G	E	T	I	H	T
Template Known Secondary structure													T	T		G	G	G			T	T										T	T	T	T				.				T	T	S														S	S		S	B						T	T	G	G	G			S					G
Template Predicted Secondary structure																																							.
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.		.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	D	Q	F	I	K	A	N	Q	V	D	K	V	L	V	V	G	A	G	Y	V	S	L	E	V	L	E	N	L	N	E	R	G	L	H	P	T	L	I	H	R	S	D	K	I	N	K	L	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	W	P	E	G	K	S	L	A	G	R	R	V	G	V	I	G	T	G	S	T	G	Q	Q	V	I	T	S	L	A	P	E	V	E	H	L	T	V	F	V	R	T	P	Q	Y	S	V	P	V	G	N	R	P	V	N	P	E	Q	I	A	E	I	K	A	D	Y	D	R	I	W	E	R	A	K	N	S	A	V	A
Template Known Secondary structure		G	G			T	T				T	T	S								S														S	S							S	S											B												T										T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
																																																																			188	.	190	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	D	M	N	Q	P	I	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	G	F	E	E	S	T	L	P	A	M	S	V	S	E	E	E	R	N	R	I	F	Q	E	A	W	D	H	G	G	G	F	R	F	M	F	G	T	F	G	D	I	A	T	D	E	A	A	N	E	A	A	A	S	F	I	R	A	K	V	A	E	I	I	E	D	P	E	T	A	R	K	L	M	P	K	G	L	F	A
Template Known Secondary structure		S	S	S							S	T	T	S																								S	S		S		T	T	T																						S											S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
											196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.			.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																																								.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																																								.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	E	L	D	K	R	E	I	P	Y	R	L	.	.	N	E	E	I	N	A	I	N	G	N	E	I	T	F	K	S	G	K	V	E	H	Y	D	M	I	I	E	G	V	G	T	H	P	N	S	K	F	I	E	S	S	N	I	K	L	D	R	K	G	F	I	P	V	N	D	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																																								.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																												.												.
Template Conservation																																																																					.
Template Sequence		K	R	P	L	C	D	S	G	Y	Y	E	V	Y	N	R	P	N	V	E	A	V	A	I	K	E	N	P	I	R	E	V	T	A	K	G	V	V	T	E	D	G	V	L	H	E	L	D	V	L	V	F	A	T	G	F	D	A	V	D	G	N	Y	R	R	I	E	I	.	R	G	R	D	G	L	H	I	N	D	H	W
Template Known Secondary structure		S	S					S	S	T	G	G	G	G	G	S	T	T						T	T	T	S							T	T					T	T	S						S								B			S	S					T	S			.			G	G	G		B					T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.		.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
											264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	F	E	T	N	V	P	N	I	Y	A	I	G	D	I	A	T	S	H	Y	R	H	V	D	L	P	A	S	V	P	L	A	W	G	A	H	R	A	A	S	I	V	A	E	Q	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	Q	P	T	S	Y	L	G	V	S	T	A	N	F	P	N	W	F	M	V	L	G	P	N	G	P	F	T	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	S	I	E	T	Q	V	E	W	I	S	D	T	I
Template Known Secondary structure		S	S	S				B	T	T	T	B		T	T		T	T				S	S		S	S				S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.										.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.