Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P58006 Date Tue Jul 30 13:03:56 BST 2013 Unique Job ID ec23aefa4f8e1bc7

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	L	A	A	A	S	N	E	A	Y	A	A	S	L	A	V	S	E	L	L	S	C	H	Q	C	G	G	D	R	G	Q	D	E	E	L	G	I	R	I	P	R	P	L	G	H	G	P	S	R	F	I	P	E	K	E	M	L	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?		?	?	?	?					?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?		?		?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	S	E	D	A	Q	M	H	A	L	F	A	D	S	F	A	A	L	G	R	L	D	N	I	T	L	V	M	V	F	H	P	Q	Y	L	E	S	F	L	K	T	Q	H	Y	L	L	Q	M	D	G	P	L	P	L	H	Y	R	H	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	I	M	A	A	A	R	H	Q	C	S	Y	L	V	N	L	H	V	S	D	F	L	H	V	G	G	D	P	K	W	L	N	G	L	E	N	A	P	Q	K	L	Q	N	L	G	E	L	N	K	V	L	A	H	R	P	W	L	I	T	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	H	I	E	G	L	L	K	A	E	E	H	S	W	S	L	A	E	L	V	H	A	V	V	L	L	T	H	Y	H	S	L	A	S	F	T	F	G	C	G	I	S	P	E	I	H	C	D	G	G	H	T	F	R	P	P	S	V	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	C	I	C	D	I	T	N	G	N	H	S	V	D	E	M	Q	V	N	S	A	G	N	A	S	V	S	D	S	F	F	E	V	E	A	L	M	E	K	M	R	Q	L	Q	E	C	R	E	E	E	E	A	S	Q	E	E	M	A	S	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	E	M	E	K	R	E	S	M	F	V	F	S	S	D	D	D	E	V	T	P	A	R	D	V	S	R	H	F	E	D	T	S	Y	G	Y	K	D	F	S	R	H	G	M	H	V	P	T	F	R	V	Q	D	Y	C	W	E	D	H	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	S	L	V	N	R	L	Y	P	D	V	G	Q	L	I	D	E	K	F	H	I	A	Y	N	L	T	Y	N	T	M	A	M	H	K	D	V	D	T	S	M	L	R	R	A	I	W	N	Y	I	H	C	M	F	G	I	R	Y	D	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	Y	G	E	I	N	Q	L	L	D	R	S	F	K	V	Y	I	K	T	V	V	C	T	P	E	K	V	T	K	R	M	Y	D	S	F	W	R	Q	F	K	H	S	E	K	V	H	V	N	L	L	L	I	E	A	R	M	Q	A	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Sequence		L	Y	A	L	R	A	I	T	R	Y	M	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand