Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P14234 Date Wed Jul 10 14:36:25 BST 2013 Unique Job ID d1975300f534fe81

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	G	C	V	F	C	K	K	L	E	P	A	S	K	E	D	V	G	L	E	G	D	F	R	S	Q	T	A	E	E	R	Y	F	P	D	P	T	Q	G	R	T	S	S	V	F	P	Q	P	T	S	P	A	F	L	N	T	G	N	M	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	I	S	G	T	G	V	T	I	F	V	A	L	Y	D	Y	E	A	R	T	G	D	D	L	T	F	T	K	G	E	K	F	H	I	L	N	N	T	E	Y	D	W	W	E	A	R	S	L	S	S	G	H	R	G	Y	V	P	S	N	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?											?		?	?	?	?	?	?															?								?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	A	P	V	D	S	I	Q	A	E	E	W	Y	F	G	K	I	S	R	K	D	A	E	R	Q	L	L	S	S	G	N	P	Q	G	A	F	L	I	R	E	S	E	T	T	K	G	A	Y	S	L	S	I	R	D	W	D	Q	N	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?																						?																	?												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	H	I	K	H	Y	K	I	R	K	L	D	T	G	G	Y	Y	I	T	T	R	A	Q	F	D	S	I	Q	D	L	V	R	H	Y	M	E	V	N	D	G	L	C	Y	L	L	T	A	P	C	T	T	T	K	P	Q	T	L	G	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?														?	?	?	?	?								?		?	?	?	?	?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	D	A	W	E	I	D	R	N	S	I	A	L	E	R	R	L	G	T	G	C	F	G	D	V	W	L	G	T	W	N	C	S	T	K	V	A	V	K	T	L	K	P	G	T	M	S	P	K	A	F	L	E	E	A	Q	I	M	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?															?																											?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	R	H	D	K	L	V	Q	L	Y	A	V	V	S	E	E	P	I	Y	I	V	T	E	F	M	C	Y	G	S	L	L	D	F	L	K	D	R	E	G	Q	N	L	M	L	P	H	L	V	D	M	A	A	Q	V	A	E	G	M	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	E	R	M	N	Y	I	H	R	D	L	R	A	A	N	I	L	V	G	E	Y	L	I	C	K	I	A	D	F	G	L	A	R	L	I	E	D	N	E	Y	N	P	Q	Q	G	T	K	F	P	I	K	W	T	A	P	E	A	A	L	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	R	F	T	V	K	S	D	V	W	S	F	G	I	L	L	T	E	L	I	T	K	G	R	V	P	Y	P	G	M	N	N	R	E	V	L	E	Q	V	E	H	G	Y	H	M	P	C	P	P	G	C	P	A	S	L	Y	E	V	M	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	A	W	R	L	D	P	E	E	R	P	T	F	E	Y	L	Q	S	F	L	E	D	Y	F	T	S	T	E	P	Q	Y	Q	P	G	D	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?				?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand