Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P97504 Date Wed Jul 10 14:16:15 BST 2013 Unique Job ID 72fc47a2ec5d4ae0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	S	K	S	I	L	E	E	L	L	L	K	K	S	Q	Q	K	K	K	M	S	P	N	N	Y	K	E	R	L	F	V	L	T	K	T	S	L	S	Y	Y	E	Y	D	K	M	K	R	G	S	R	K	G	S	I	E	I	K	K	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	C	V	E	K	V	N	L	E	E	Q	T	P	V	E	R	Q	Y	P	F	Q	I	V	Y	K	D	G	L	L	Y	V	Y	A	S	N	E	E	S	R	C	Q	W	L	K	A	L	Q	K	E	I	R	G	N	P	H	L	L	I	K	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		H	S	G	F	F	V	D	G	K	F	L	C	C	Q	Q	S	C	K	A	A	P	G	C	T	L	W	E	A	Y	A	D	L	H	I	A	I	S	D	E	K	H	R	A	P	T	F	P	E	R	L	L	K	I	P	R	A	V	P	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	M	D	A	S	S	S	G	A	I	L	P	Q	Y	D	S	Y	S	K	K	S	C	G	S	Q	P	T	S	N	I	R	Y	I	P	R	E	D	C	P	D	W	W	Q	V	R	K	L	K	S	E	E	D	I	A	C	S	N	Q	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?																			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	N	I	A	S	H	S	T	S	K	M	S	W	G	F	P	E	S	S	S	S	E	E	E	E	N	L	H	A	Y	D	W	F	A	G	N	I	S	R	S	Q	S	E	Q	L	L	R	Q	K	G	K	E	G	A	F	M	V	R	N	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?																							?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	Q	M	G	M	Y	T	V	S	L	F	S	K	A	V	N	D	K	K	G	T	V	K	H	Y	H	V	H	T	N	A	E	N	K	L	Y	L	A	E	N	Y	C	F	D	S	I	P	K	L	I	H	Y	H	Q	H	N	S	A	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?		?																									?														?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	T	R	L	R	H	P	V	S	T	K	A	N	K	V	P	V	S	V	A	L	G	S	G	I	W	E	L	K	R	E	E	I	T	L	L	K	E	L	G	N	G	Q	F	G	V	V	Q	L	G	Q	W	K	G	Q	Y	D	V	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?	?	?	?				?	?		?		?	?	?			?															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	M	I	K	E	G	A	M	S	E	D	E	F	F	Q	E	A	Q	T	M	M	K	L	S	H	P	K	L	V	K	F	Y	G	V	C	S	K	K	Y	P	I	Y	I	V	T	E	Y	I	T	N	G	C	L	L	N	Y	L	K	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?			?	?																																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		G	K	G	L	E	S	C	Q	L	L	E	M	C	Y	D	V	C	E	G	M	A	F	L	E	S	H	Q	F	I	H	R	D	L	A	A	R	N	C	L	V	D	S	D	L	S	V	K	V	S	D	F	G	M	T	R	Y	V	L	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Q	Y	V	S	S	V	G	T	K	F	P	V	K	W	S	A	P	E	V	F	H	Y	F	K	Y	S	S	K	S	D	V	W	A	F	G	I	L	M	W	E	V	F	S	L	G	K	Q	P	Y	D	L	Y	D	N	S	E	V	V	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.
Sequence		V	S	Q	G	H	R	L	Y	R	P	Q	L	A	S	D	T	I	Y	Q	I	M	Y	S	C	W	H	E	L	P	E	K	R	P	T	F	Q	Q	L	L	S	A	I	E	P	L	R	E	Q	D	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?	?		?		?																	?				?															?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand