Phyre 2 Results for A1A535

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	A1A535
Date	Wed Jul 10 14:03:03 BST 2013
Unique Job ID	671d1baf5f3b7c66

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M H Q L F R L V L G Q K D L S K A G D L F S L D D A E I E D S L T E A L E Q I K V I S S S L D Y Q T N N N D Q A V V E I

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ?
?
?
?
?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence C I T R I T T A I R E T E S I E K H A R A L V G L W D S C L E H N L R P A G K D E D T P H A K I A S D I M S C I L Q N Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence N R T P V M V L A V P I A V K F L H R G S K E L C R N M S N Y L S L A A I T K A D L L A D H T E G I I K S I L Q G N A M

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence L L R V L P A V Y E K Q P Q P I N R H L A E L L A L M S Q L E Q T E Q Y H L L R L L H V A A K R K D V E V V Q K C V P F

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ?
? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence L I R N L K D S T Y N D I I L N I L I E I A G H E P L A L N S F L P M L K E I A E Q F P Y L T G Q M A R I F G A V G H V

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ?
?
? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence D E E R A R S C L R Y L V S Q L A N M E H P F H H I L L L E I K S I T D A F S S I L G P H S R D I F R M S N S F T N I A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ?
? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ?
?
? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence K L L S R Q L E N S K A D S S R R K T S T E V S I P E K L R E L N S M E P E S E D H E K L Q V K I Q A F E D K I N A E S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence N T P G S G R R Y S L D H I S K E E R K S I R F S R S R S L A L N T V L T N G V S V E D N E V E E K A G M H A S I S L S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence Q I D P L S H G I G K L P F K T D T H E S P L R N S S A S H P S I I H I E P E T M P E T F K E N I Q E E I L E A A T S P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence V E Y Q D K L Y L H L R E N L S K V K A Y A L E I A K K V P I P D Q C T I E D T M R S C V A K L F F T C S L K G H Y C L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ?
?
? ?
?
? ?
? ? ? ? ? ? ?
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence Y S K S S F I L V S Q A P Q P W I Q V M F L S Q Q S L F P E P L S I Q S G S V Q F L K A L W E K T Q D T G A H S F E V A

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?
? ? ? ? ?
? ? ?
? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence M T E S T F P Q Q K D L E Q L Q L H L E E V R F F D V F G F S E T A G A W Q C F M C N N P E K A T V V N Q D G Q P L I E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence G K L K E K Q V R W K F I K R W K T R Y F T L A G N Q L L F Q K G K S K D D P D D P P I E L S K V Q S V K A V A K K R R

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . .

Sequence D R S L P R A F E I F T D S K T Y V F K A K D E K N A E E W L Q C I N V A L A Q A K E R E S R E V T T Y L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand