Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q80TT8 Date Wed Jul 10 14:12:26 BST 2013 Unique Job ID 3c2b219eb02043cd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	R	A	L	R	G	P	G	P	R	S	S	L	D	Q	H	V	A	A	V	L	A	T	V	Q	I	S	S	L	D	T	N	L	Q	L	S	G	L	C	A	L	S	Q	A	V	E	E	V	T	E	R	D	H	P	L	V	R	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	P	L	R	E	K	L	V	K	T	L	V	D	L	L	T	N	Q	V	G	E	K	M	V	V	V	M	A	L	R	L	L	Y	L	L	M	T	K	H	E	W	R	P	L	F	A	R	E	G	G	I	Y	A	V	L	I	C	M	Q	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?														?			?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	K	T	S	V	L	V	Q	Q	A	G	L	A	A	L	K	M	L	A	I	A	N	S	S	D	V	P	T	F	I	P	S	R	D	S	I	Q	P	L	F	D	T	Q	M	T	R	E	I	F	A	S	I	D	S	A	T	R	P	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?			?	?	?		?							?			?				?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	S	L	L	L	S	V	P	A	A	V	V	L	M	L	N	T	E	G	C	S	S	A	V	R	N	G	L	L	L	L	N	L	L	L	C	N	H	H	T	L	G	D	Q	I	I	T	Q	E	L	R	D	T	L	F	R	H	S	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?					?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	P	G	T	E	P	M	P	T	T	R	T	I	L	T	M	L	L	S	R	Y	S	E	P	R	G	S	P	E	R	A	V	L	E	T	P	S	T	Q	G	Q	D	G	S	P	E	S	L	I	R	S	L	V	G	D	L	S	A	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	L	D	L	E	R	V	L	C	H	E	G	S	P	P	A	A	V	R	P	L	L	R	R	L	Q	Q	E	T	Q	P	F	L	L	L	L	R	T	L	D	A	P	G	P	N	R	T	L	L	L	T	I	L	R	V	M	T	R	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?																								?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	H	P	E	T	M	V	L	P	W	H	E	V	L	E	P	C	L	N	C	L	N	G	P	S	S	D	S	E	V	V	Q	E	V	T	C	F	L	H	R	L	A	L	M	Q	K	D	Y	A	V	V	L	C	C	L	G	G	K	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	S	K	V	L	D	K	H	S	T	Q	L	L	L	A	S	E	L	R	H	L	V	A	E	C	E	K	Y	S	Q	L	C	S	N	L	T	S	S	I	L	A	G	C	I	Q	M	V	L	G	Q	I	E	D	H	R	R	T	Y	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?			?	?																																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	T	I	P	F	F	D	V	F	L	R	H	L	C	Q	G	S	S	V	E	V	K	E	D	R	C	W	E	K	V	E	V	S	S	N	P	H	R	A	S	K	L	T	D	R	N	P	K	T	Y	W	E	S	N	G	S	T	G	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	I	T	L	H	M	H	R	G	V	L	I	R	Q	L	T	L	L	V	A	S	E	D	S	S	Y	M	P	A	R	V	V	V	F	G	G	D	N	V	G	C	I	S	T	E	L	N	T	V	N	V	M	P	S	A	S	R	V	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		L	E	N	L	T	R	F	W	P	I	I	Q	I	R	I	K	R	C	Q	Q	G	G	I	D	T	R	V	R	G	V	E	V	L	G	P	K	P	T	F	W	P	L	F	R	E	Q	L	C	R	R	T	C	L	F	Y	T	I	R	A	Q
Secondary structure
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Disorder																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		A	W	S	R	D	I	A	E	D	R	Q	R	L	L	Q	L	Y	P	R	L	N	R	V	L	R	H	E	Q	N	F	A	D	R	F	L	P	D	D	E	A	A	Q	A	L	G	K	T	C	W	E	A	L	V	S	P	L	V	Q	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		T	S	P	D	A	G	G	V	S	S	L	G	W	L	L	D	Q	Y	L	E	H	R	E	S	T	R	S	R	Q	G	P	A	A	S	F	A	S	Q	V	R	R	L	C	H	L	L	V	H	V	E	A	P	P	G	P	S	P	E	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?														?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		S	Q	P	L	S	K	N	S	K	G	Q	D	G	S	P	T	P	A	P	T	P	V	C	P	S	T	S	L	R	N	L	T	Q	C	W	L	S	V	V	Q	G	Q	V	S	R	F	L	A	A	A	W	R	A	S	D	F	V	P	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		C	S	L	Y	Q	R	L	Q	S	A	G	S	E	L	F	G	P	R	A	A	F	T	L	A	L	R	S	G	F	S	G	A	L	L	Q	Q	S	F	L	T	A	A	H	I	S	E	Q	F	A	R	H	I	D	Q	Q	I	H	G	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		L	G	G	A	A	G	V	G	M	L	G	R	L	Q	R	H	L	E	P	I	M	V	L	S	G	L	E	L	A	T	T	F	E	H	F	Y	Q	H	Y	M	A	D	R	L	L	S	L	G	S	S	W	L	E	G	A	V	L	E	Q	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																																							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		G	P	C	F	P	N	R	L	P	Q	L	M	L	Q	S	L	H	T	S	E	E	L	Q	H	R	F	H	L	F	Q	L	Q	Q	L	D	R	Q	L	L	E	Q	G	D	Q	E	E	W	R	P	E	K	V	E	E	D	D	E	G	Q	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		T	G	R	E	L	F	T	D	P	G	P	A	I	S	V	L	V	L	S	P	R	C	W	P	V	S	P	L	C	Y	L	H	H	P	R	K	H	L	Q	A	E	L	C	D	A	L	E	R	F	S	S	F	Y	S	H	S	Q	N	C	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?		?	?																					?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		V	L	D	I	G	P	H	R	R	L	Q	W	T	W	L	G	R	A	E	L	Q	L	G	D	Q	T	L	H	V	S	L	N	T	V	Q	M	W	L	L	F	N	Q	S	E	E	V	S	V	E	T	L	L	R	N	S	D	L	S	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		L	L	H	Q	A	L	L	P	L	T	S	D	N	G	P	L	T	L	E	E	T	Q	D	Y	P	Q	G	G	V	L	R	L	R	E	P	R	S	Q	T	H	E	E	F	L	W	L	I	P	P	Q	T	Y	L	S	V	E	K	D	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?								?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		R	T	L	E	Q	K	R	N	L	L	S	C	L	L	V	R	I	L	K	A	H	R	E	K	G	L	H	I	D	Q	L	V	C	L	V	L	E	A	W	Q	K	G	P	D	P	P	G	R	L	G	N	A	A	A	V	G	V	A	C	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		S	T	D	V	L	S	C	I	L	H	L	L	G	Q	G	Y	V	E	R	R	D	D	R	P	Q	V	L	M	Y	A	T	P	E	P	M	G	P	C	R	G	Q	A	D	V	P	F	C	G	N	K	N	T	E	T	S	R	P	S	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380
Sequence		A	V	V	A	L	A	S	L	Q	L	P	A	G	R	T	M	S	P	Q	E	V	E	G	L	M	E	Q	T	V	R	Q	V	Q	E	T	L	N	L	E	P	D	V	A	Q	H	L	L	A	H	S	H	W	G	T	E	Q	L	L	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																												?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440
Sequence		Y	S	D	D	P	E	P	L	L	L	A	A	G	L	R	V	P	Q	A	Q	V	V	P	T	R	P	D	Q	C	P	V	C	V	T	P	L	G	P	H	D	D	S	P	S	L	C	C	L	H	C	C	C	K	S	C	W	N	E	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500
Sequence		T	T	R	I	E	Q	N	F	V	L	N	C	T	C	P	I	A	D	C	P	A	Q	P	T	G	A	F	I	R	N	I	V	S	S	P	E	V	I	S	K	Y	E	K	A	L	L	R	G	Y	V	E	S	C	S	N	L	T	W	C	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560
Sequence		N	P	Q	G	C	D	R	I	L	C	R	Q	G	L	G	S	G	T	T	C	S	K	C	G	W	A	S	C	F	S	C	S	F	P	E	A	H	Y	P	A	S	C	G	H	M	S	Q	W	V	D	D	G	G	Y	Y	D	G	M	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		E	A	Q	S	K	H	L	A	K	L	I	S	K	R	C	P	S	C	Q	A	P	I	E	K	N	E	G	C	L	H	M	T	C	A	R	C	N	H	G	F	C	W	R	C	L	K	S	W	K	P	S	H	K	D	Y	Y	N	C	S	A
Secondary structure
SS confidence
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Sequence		M	V	S	K	A	A	R	Q	E	K	R	F	Q	D	Y	N	E	R	C	T	F	H	H	Q	A	R	E	F	A	V	N	L	R	N	Q	A	S	A	I	Q	E	V	P	P	P	K	S	F	T	F	L	Q	D	A	C	R	A	L	E	Q
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Sequence		A	R	K	V	L	A	Y	A	C	V	Y	S	F	Y	S	Q	D	T	E	Y	M	D	V	V	E	Q	Q	T	E	N	L	E	L	H	T	N	A	L	Q	I	L	L	E	E	T	L	L	R	C	R	D	L	A	S	S	L	R	F	L	R
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Sequence		A	D	C	L	S	T	G	T	E	L	L	R	R	I	Q	E	R	L	L	A	I	L	Q	H	S	T	Q	D	F	R	V	G	L	Q	S	P	S	V	E	T	R	E	V	K	G	S	N	V	P	S	D	Q	P	Q	G	S	S	G	L	E
Secondary structure
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Sequence		V	E	D	E	E	E	E	E	E	E	E	E	E	E	E	E	E	E	E	E	D	V	P	E	W	Q	H	E	F	D	E	E	L	D	N	D	S	F	S	Y	D	E	E	S	E	N	L	D	R	E	T	F	F	F	G	D	E	D	E	D
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?			?	?		?		?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?
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Sequence		D	E	S	Y	D
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