Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q5SQX6 Date Wed Jul 10 14:11:20 BST 2013 Unique Job ID 1965ac2a29e64fe2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	T	H	V	T	L	E	D	A	L	S	N	V	D	L	L	E	E	L	P	L	P	D	Q	Q	P	C	I	E	P	P	P	S	S	I	M	Y	Q	A	N	F	D	T	N	F	E	D	R	N	A	F	V	T	G	I	A	R	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?												?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?												?			?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	Q	A	T	V	H	S	S	M	N	E	M	L	E	E	G	H	D	Y	A	V	M	L	Y	T	W	R	S	C	S	R	A	I	P	Q	V	K	C	N	E	Q	P	N	R	V	E	I	Y	E	K	T	V	E	V	L	E	P	E	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																														?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	L	M	K	F	M	Y	F	Q	R	K	A	I	E	R	F	C	S	E	V	K	R	L	C	H	A	E	R	R	K	D	F	V	S	E	A	Y	L	L	T	L	G	K	F	I	N	M	F	A	V	L	D	E	L	K	N	M	K	C	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	K	N	D	H	S	A	Y	K	R	A	A	Q	F	L	R	K	M	A	D	P	Q	S	I	Q	E	S	Q	N	L	S	M	F	L	A	N	H	N	R	I	T	Q	C	L	H	Q	Q	L	E	V	I	P	G	Y	E	E	L	L	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	V	N	I	C	V	D	Y	Y	E	N	K	M	Y	L	T	P	S	E	K	H	M	L	L	K	V	M	G	F	G	L	Y	L	M	D	G	N	V	S	N	I	Y	K	L	D	A	K	K	R	I	N	L	S	K	I	D	K	F	F	K
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SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	L	Q	V	V	P	L	F	G	D	M	Q	I	E	L	A	R	Y	I	K	T	S	A	H	Y	E	E	N	K	S	K	W	T	C	T	Q	S	S	I	S	P	Q	Y	N	I	C	E	Q	M	V	Q	I	R	D	D	H	I	R	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?									?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	E	L	A	R	Y	S	N	S	E	V	V	T	G	S	G	L	D	S	Q	K	S	D	E	E	Y	R	E	L	F	D	L	A	L	R	G	L	Q	L	L	S	K	W	S	A	H	V	M	E	V	Y	S	W	K	L	V	H	P	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	F	C	N	K	D	C	P	G	T	A	E	E	Y	E	R	A	T	R	Y	N	Y	T	S	E	E	K	F	A	F	V	E	V	I	A	M	I	K	G	L	Q	V	L	M	G	R	M	E	S	V	F	N	Q	A	I	R	N	T	I	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	A	L	Q	D	F	A	Q	V	T	L	R	E	P	L	R	Q	A	V	R	K	K	K	N	V	L	I	S	V	L	Q	A	I	R	K	T	I	C	D	W	E	G	G	R	E	P	P	N	D	P	C	L	R	G	E	K	D	P	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		G	F	D	I	K	V	P	R	R	A	V	G	P	S	S	T	Q	L	Y	M	V	R	T	M	L	E	S	L	I	A	D	K	S	G	S	K	K	T	L	R	S	S	L	D	G	P	I	V	L	A	I	E	D	F	H	K	Q	S	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		F	T	H	L	L	N	I	S	E	A	L	Q	Q	C	C	D	L	S	Q	L	W	F	R	E	F	F	L	E	L	T	M	G	R	R	I	Q	F	P	I	E	M	S	M	P	W	I	L	T	D	H	I	L	E	T	K	E	P	S	M	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		E	Y	V	L	Y	P	L	D	L	Y	N	D	S	A	Y	Y	A	L	T	K	F	K	K	Q	F	L	Y	D	E	I	E	A	E	V	N	L	C	F	D	Q	F	V	Y	K	L	A	D	Q	I	F	A	Y	Y	K	A	M	A	G	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		L	L	D	K	R	F	R	A	E	C	K	N	Y	G	V	I	I	P	Y	P	P	S	N	R	Y	E	T	L	L	K	Q	R	H	V	Q	L	L	G	R	S	I	D	L	N	R	L	I	T	Q	R	I	S	A	A	M	Y	K	S	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?							?		?	?	?	?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		Q	A	I	S	R	F	E	S	E	D	L	T	S	I	V	E	L	E	W	L	L	E	I	N	R	L	T	H	R	L	L	C	K	H	M	T	L	D	S	F	D	A	M	F	R	E	A	N	H	N	V	S	A	P	Y	G	R	I	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		H	V	F	W	E	L	N	F	D	F	L	P	N	Y	C	Y	N	G	S	T	N	R	F	V	R	T	A	I	P	F	T	Q	E	P	Q	R	D	K	P	A	N	V	Q	P	Y	Y	L	Y	G	S	K	P	L	N	I	A	Y	S	H	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		Y	S	S	Y	R	N	F	V	G	P	P	H	F	K	T	I	C	R	L	L	G	Y	Q	G	I	A	V	V	M	E	E	L	L	K	I	V	K	S	L	L	Q	G	T	I	L	Q	Y	V	K	T	L	I	E	V	M	P	K	I	C	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?				?																																																	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		L	P	R	H	E	Y	G	S	P	G	I	L	E	F	F	H	H	Q	L	K	D	I	I	E	Y	A	E	L	K	T	D	V	F	Q	S	L	R	E	V	G	N	A	I	L	F	C	L	L	I	E	Q	A	L	S	Q	E	E	V	C	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		L	L	H	A	A	P	F	Q	N	I	L	P	R	V	Y	I	K	E	G	E	R	L	E	V	R	M	K	R	L	E	A	K	Y	A	P	L	H	L	V	P	L	I	E	R	L	G	T	P	Q	Q	I	A	I	A	R	E	G	D	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?			?				?							?					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		T	K	E	R	L	C	C	G	L	S	M	F	E	V	I	L	T	R	I	R	S	Y	L	Q	D	P	I	W	R	G	P	P	P	T	N	G	V	M	H	V	D	E	C	V	E	F	H	R	L	W	S	A	M	Q	F	V	Y	C	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																					?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		V	G	T	N	E	F	T	A	E	Q	C	F	G	D	G	L	N	W	A	G	C	S	I	I	V	L	L	G	Q	Q	R	R	F	D	L	F	D	F	C	Y	H	L	L	K	V	Q	R	Q	D	G	K	D	E	I	I	K	N	V	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.
Sequence		K	K	M	A	D	R	I	R	K	Y	Q	I	L	N	N	E	V	F	A	I	L	N	K	Y	M	K	S	V	E	T	D	S	S	T	V	E	H	V	R	C	F	Q	P	P	I	H	Q	S	L	A	T	T	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?
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