Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P24604 Date Tue Jul 30 13:00:36 BST 2013 Unique Job ID 0c49007f439466a0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	F	N	T	I	L	E	E	I	L	I	K	R	S	Q	Q	K	K	K	T	S	L	L	N	Y	K	E	R	L	C	V	L	P	K	S	V	L	S	Y	Y	E	G	R	A	E	K	K	Y	R	K	G	V	I	D	I	S	K	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?																				?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		C	V	E	I	V	K	N	D	D	G	V	I	P	C	Q	N	K	F	P	F	Q	V	V	H	D	A	N	T	L	Y	I	F	A	P	S	P	Q	S	R	D	R	W	V	K	K	L	K	E	E	I	K	N	N	N	N	I	M	I	K	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		H	P	K	F	W	A	D	G	S	Y	Q	C	C	R	Q	T	E	K	L	A	P	G	C	E	K	Y	N	L	F	E	S	S	I	R	K	T	L	P	P	A	P	E	I	K	K	R	R	P	P	P	P	I	P	P	E	E	E	N	T	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?		?	?	?	?				?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	I	V	V	A	M	Y	D	F	Q	A	T	E	A	H	D	L	R	L	E	R	G	Q	E	Y	I	I	L	E	K	N	D	L	H	W	W	R	A	R	D	K	Y	G	S	E	G	Y	I	P	S	N	Y	V	T	G	K	K	S	N	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?																							?		?	?												?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	D	Q	Y	E	W	Y	C	R	N	T	N	R	S	K	A	E	Q	L	L	R	T	E	D	K	E	G	G	F	M	V	R	D	S	S	Q	P	G	L	Y	T	V	S	L	Y	T	K	F	G	G	E	G	S	S	G	F	R	H	Y	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																			?	?	?		?													?												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	K	E	T	A	T	S	P	K	K	Y	Y	L	A	E	K	H	A	F	G	S	I	P	E	I	I	E	Y	H	K	H	N	A	A	G	L	V	T	R	L	R	Y	P	V	S	T	K	G	K	N	A	P	T	T	A	G	F	S	Y	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?								?		?	?	?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	W	E	I	N	P	S	E	L	T	F	M	R	E	L	G	S	G	L	F	G	V	V	R	L	G	K	W	R	A	Q	Y	K	V	A	I	K	A	I	R	E	G	A	M	C	E	E	D	F	I	E	E	A	K	V	M	M	K	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																											?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		H	P	K	L	V	Q	L	Y	G	V	C	T	Q	Q	K	P	I	Y	I	V	T	E	F	M	E	R	G	C	L	L	N	F	L	R	Q	R	Q	G	H	F	S	R	D	M	L	L	S	M	C	Q	D	V	C	E	G	M	E	Y	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		R	N	S	F	I	H	R	D	L	A	A	R	N	C	L	V	N	E	A	G	V	V	K	V	S	D	F	G	M	A	R	Y	V	L	D	D	Q	Y	T	S	S	S	G	A	K	F	P	V	K	W	C	P	P	E	V	F	N	Y	S	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		F	S	S	K	S	D	V	W	S	F	G	V	L	M	W	E	I	F	T	E	G	R	M	P	F	E	K	N	T	N	Y	E	V	V	T	M	V	T	R	G	H	R	L	H	R	P	K	L	A	T	K	Y	L	Y	E	V	M	L	R	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?		?	?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630
Sequence		W	Q	E	R	P	E	G	R	P	S	L	E	D	L	L	R	T	I	D	E	L	V	E	C	E	E	T	F	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?																?	?			?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand