Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39023 Date Thu Apr 26 09:26:30 BST 2012 Unique Job ID fe687422d43f91ad

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	H	R	K	F	S	A	P	R	H	G	S	L	G	F	L	P	R	K	R	S	S	R	H	R	G	K	V	K	S	F	P	K	D	D	P	S	K	P	V	H	L	T	A	F	L	G	Y	K	A	G	M	T	H	I	V	R	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	R	P	G	S	K	V	N	K	K	E	V	V	E	A	V	T	I	V	E	T	P	P	M	V	V	V	G	I	V	G	Y	V	E	T	P	R	G	L	R	T	F	K	T	V	F	A	E	H	I	S	D	E	C	K	R	R	F	Y	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?																																												?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	W	H	K	S	K	K	K	A	F	T	K	Y	C	K	K	W	Q	D	E	D	G	K	K	Q	L	E	K	D	F	S	S	M	K	K	Y	C	Q	V	I	R	V	I	A	H	T	Q	M	R	L	L	P	L	R	Q	K	K	A	H	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	E	I	Q	V	N	G	G	T	V	A	E	K	L	D	W	A	R	E	R	L	E	Q	Q	V	P	V	N	Q	V	F	G	Q	D	E	M	I	D	V	I	G	V	T	K	G	K	G	Y	K	G	V	T	S	R	W	H	T	K	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?		?		?																																																	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	R	K	T	H	R	G	L	R	K	V	A	C	I	G	A	W	H	P	A	R	V	A	F	S	V	A	R	A	G	Q	K	G	Y	H	H	R	T	E	I	N	K	K	I	Y	K	I	G	Q	G	Y	L	I	K	D	G	K	L	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?																																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	N	A	S	T	D	Y	D	L	S	D	K	S	I	N	P	L	G	G	F	V	H	Y	G	E	V	T	N	D	F	V	M	L	K	G	C	V	V	G	T	K	K	R	V	L	T	L	R	K	S	L	L	V	Q	T	K	R	R	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?			?																																			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Sequence		E	K	I	D	L	K	F	I	D	T	T	S	K	F	G	H	G	R	F	Q	T	M	E	E	K	K	A	F	M	G	P	L	K	K	D	R	I	A	K	E	E	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand