Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A1IGU5 Date Thu Apr 26 09:49:45 BST 2012 Unique Job ID f8052f883022ad14

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	K	H	G	A	D	E	P	S	S	R	S	G	S	P	D	R	E	G	R	A	S	E	D	R	S	L	L	H	Q	R	L	A	V	R	E	L	I	D	T	E	V	S	Y	L	H	M	L	Q	L	C	A	S	D	I	R	S	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	Q	L	P	Q	G	D	L	D	V	L	F	S	N	I	D	D	I	I	K	V	N	S	R	F	L	H	D	L	Q	E	T	A	S	K	E	E	E	Q	V	Q	L	V	G	N	I	F	L	E	F	Q	E	E	L	E	Q	V	Y	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	C	A	S	Y	D	Q	A	L	L	L	V	D	T	Y	R	K	E	P	E	L	Q	R	H	I	Q	G	I	V	E	A	V	V	P	Q	A	G	S	S	G	L	S	F	L	L	V	I	P	L	Q	R	I	T	R	Y	P	L	L	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	I	L	E	N	T	V	P	D	A	S	A	Y	P	V	L	Q	R	A	V	S	A	L	Q	D	V	N	T	N	I	N	E	Y	K	M	R	K	E	V	A	S	K	Y	T	K	V	E	Q	L	T	L	R	E	R	L	A	R	I	N	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?																																									?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		H	T	L	S	K	K	T	T	R	L	S	Q	L	L	K	Q	E	A	G	L	I	P	R	T	E	D	K	E	F	D	D	L	E	E	R	F	Q	W	V	S	L	C	V	T	E	L	K	N	N	V	A	A	Y	L	D	N	L	Q	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?	?	?										?	?	?	?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	Y	F	R	P	H	E	Y	N	L	D	I	P	E	G	P	A	V	Q	Y	C	N	L	A	R	D	L	H	L	E	A	F	L	K	F	K	Q	R	L	E	G	L	V	W	Q	P	L	C	S	L	A	K	A	L	L	G	P	Q	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	K	K	R	L	D	K	L	L	D	F	E	R	V	E	E	K	L	L	E	V	G	S	V	T	Y	Q	E	E	A	A	R	H	T	Y	Q	A	L	N	S	L	L	V	A	E	L	P	Q	F	N	Q	L	V	M	Q	W	L	G	Q	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		M	C	T	F	V	T	L	Q	R	D	L	A	K	Q	V	L	Q	R	A	E	G	S	M	A	Q	L	P	H	H	H	V	P	E	P	A	F	R	K	L	V	E	D	A	L	G	R	T	S	N	Q	L	R	S	F	Q	E	T	F	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	Q	P	P	P	T	T	Q	P	L	L	P	G	S	E	R	Q	V	Q	A	L	L	S	R	Y	G	P	G	K	L	Y	Q	V	T	S	N	I	S	G	T	G	T	L	D	L	T	L	P	R	G	Q	I	V	A	I	L	Q	N	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?		?	?		?	?		?	?													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	K	G	N	S	G	R	W	L	V	D	T	G	G	H	R	G	Y	V	P	A	G	K	L	Q	L	Y	H	V	V	P	S	A	E	E	L	R	R	Q	A	G	L	N	K	D	P	R	C	L	T	P	E	P	S	P	A	L	V	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?	?	?									?	?	?	?		?		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		I	P	T	M	N	Q	V	I	A	A	Y	P	F	V	A	R	S	S	H	E	V	S	L	Q	A	G	Q	P	V	T	I	L	E	A	Q	D	K	K	G	N	P	E	W	S	L	V	E	V	N	G	Q	R	G	Y	V	P	S	G	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?			?	?												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.
Sequence		A	R	A	R	S	P	V	L	W	G	W	S	L	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand