Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0PJZ3 Date Sat Jun 16 10:31:38 BST 2012 Unique Job ID eab9cd653f9ed7b9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	L	R	S	K	A	A	A	L	L	L	L	A	L	A	A	L	L	L	A	L	L	S	L	R	A	G	R	A	E	P	P	A	L	P	A	R	P	A	S	A	P	Q	R	H	P	A	P	V	P	A	R	W	P	G	P	G	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	G	A	S	P	G	V	R	R	R	R	P	P	R	P	R	P	R	A	G	R	R	G	A	A	R	L	E	K	L	A	R	R	P	G	E	P	R	S	F	Q	A	V	L	P	P	E	L	W	I	H	L	A	V	V	A	C	G	N	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	E	E	T	L	V	M	L	K	S	A	V	L	F	S	H	R	K	I	Q	F	H	I	F	T	E	D	S	L	K	P	E	F	D	K	Q	L	R	Q	W	P	D	S	Y	T	K	K	F	E	H	R	I	Y	P	I	T	F	S	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	P	Q	E	W	K	K	L	F	K	P	C	A	A	Q	R	L	F	L	P	V	I	L	K	D	V	D	S	L	L	Y	V	D	T	D	V	L	F	L	R	P	V	D	D	I	W	K	L	L	R	L	F	N	S	T	Q	L	A	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	P	E	H	E	I	P	K	I	G	W	Y	S	R	F	A	R	H	P	F	Y	G	S	A	G	V	N	S	G	V	M	L	M	N	L	T	R	I	R	S	T	Q	F	K	N	S	M	I	P	T	G	L	A	W	E	D	M	L	Y	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	Y	Q	K	Y	K	N	A	I	T	W	G	D	Q	D	L	L	N	I	I	F	Y	F	N	P	E	C	L	Y	V	F	P	C	Q	W	N	Y	R	P	D	H	C	M	Y	G	S	N	C	R	E	A	E	H	E	G	V	S	V	L	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	N	R	G	V	Y	H	D	D	K	Q	P	T	F	R	A	L	Y	E	A	I	R	D	F	P	F	Q	D	N	L	F	Q	S	M	Y	Y	P	L	Q	L	K	F	L	E	T	V	H	T	L	C	G	R	I	P	Q	V	F	L	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?												?	?	?	?	?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
Sequence		I	E	K	T	M	K	R	A	Y	E	K	H	V	I	I	H	V	G	P	N	Q	M	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand