Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q13882 Date Wed May 9 17:41:40 BST 2012 Unique Job ID d48770a83ae49387

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	V	S	R	D	Q	A	H	L	G	P	K	Y	V	G	L	W	D	F	K	S	R	T	D	E	E	L	S	F	R	A	G	D	V	F	H	V	A	R	K	E	E	Q	W	W	W	A	T	L	L	D	E	A	G	G	A	V	A	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?														?	?	?	?	?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Y	V	P	H	N	Y	L	A	E	R	E	T	V	E	S	E	P	W	F	F	G	C	I	S	R	S	E	A	V	R	R	L	Q	A	E	G	N	A	T	G	A	F	L	I	R	V	S	E	K	P	S	A	D	Y	V	L	S	V	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?																					?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	Q	A	V	R	H	Y	K	I	W	R	R	A	G	G	R	L	H	L	N	E	A	V	S	F	L	S	L	P	E	L	V	N	Y	H	R	A	Q	S	L	S	H	G	L	R	L	A	A	P	C	R	K	H	E	P	E	P	L	P	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?	?								?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		W	D	D	W	E	R	P	R	E	E	F	T	L	C	R	K	L	G	S	G	Y	F	G	E	V	F	E	G	L	W	K	D	R	V	Q	V	A	I	K	V	I	S	R	D	N	L	L	H	Q	Q	M	L	Q	S	E	I	Q	A	M	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	L	R	H	K	H	I	L	A	L	Y	A	V	V	S	V	G	D	P	V	Y	I	I	T	E	L	M	A	K	G	S	L	L	E	L	L	R	D	S	D	E	K	V	L	P	V	S	E	L	L	D	I	A	W	Q	V	A	E	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		C	Y	L	E	S	Q	N	Y	I	H	R	D	L	A	A	R	N	I	L	V	G	E	N	T	L	C	K	V	G	D	F	G	L	A	R	L	I	K	E	D	V	Y	L	S	H	D	H	N	I	P	Y	K	W	T	A	P	E	A	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	G	H	Y	S	T	K	S	D	V	W	S	F	G	I	L	L	H	E	M	F	S	R	G	Q	V	P	Y	P	G	M	S	N	H	E	A	F	L	R	V	D	A	G	Y	R	M	P	C	P	L	E	C	P	P	S	V	H	K	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Sequence		L	T	C	W	C	R	D	P	E	Q	R	P	C	F	K	A	L	R	E	R	L	S	S	F	T	S	Y	E	N	P	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?				?															?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand