Job Description Q08881 Confidence 100.00% Date Tue Apr 3 14:36:05 BST 2012 Rank 86 Aligned Residues 333 % Identity 25% Template c3o96A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:rac-alpha serine/threonine-protein kinase; PDBTitle: crystal structure of human akt1 with an allosteric inhibitor Resolution 2.70 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	N	F	I	L	L	E	E	Q	L	I	K	K	S	Q	Q	K	R	R	T	S	P	S	N	F	K	V	R	F	F	V	L	T	K	A	S	L	A	Y	F	E	D	R	H	G	K	K	R	T	L	K	G	S	I	E	L	S	R	I	K	C	V	E	I	V	K	S	D	I	S	I	P	C	H	Y	K	Y	P	F	Q
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.																											.	.																		.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.																											.	.																		.	.	.	.
Template Sequence		D	V	A	I	V	K	E	G	W	L	H	K	R	G	E	Y	I	K	T	.	.	.	.	.	W	R	P	R	Y	F	L	L	K	N	D	G	T	F	I	G	Y	K	E	R	P	Q	D	V	E	A	.	.	P	L	N	N	F	S	V	A	Q	C	Q	L	M	K	T	E	R	.	.	.	.	P	R	P	N	T	F	I
Template Known Secondary structure																S	S	S			.	.	.	.	.										T	T	S	B					S	S			S					.	.			G	G	G	B		T	T					B			S	.	.	.	.	S	S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.																											.	.																		.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.						.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.			.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.					.	.	.	.	.	70	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.		.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure													.
Query SS confidence													.
Query Sequence		V	V	H	D	N	Y	L	L	Y	V	F	.	A	P	D	R	E	S	R	Q	R	W	V	L	A	L	K	E	E	T	R	N	N	N	S	L	V	P	K	Y	H	P	N	F	W	M	D	G	K	W	R	C	C	S	Q	L	E	K	L	A	T	G	C	A	Q	Y	D	P	T	K	N	A	S	K	K	P	L	P	P	T
Query Conservation													.
Alig confidence													.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	R	C	L	Q	W	T	T	V	I	E	R	T	F	T	P	E	E	R	E	E	W	T	T	A	I	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T									T	T	G	G	G	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	D	N	R	R	P	L	W	E	P	E	E	T	V	V	I	A	L	Y	D	Y	Q	T	N	D	P	Q	E	L	A	L	R	R	N	E	E	Y	C	L	L	D	S	S	E	I	H	W	W	R	V	Q	D	R	N	G	H	E	G	Y	V	P	S	S	Y	L	V	E	K	S	P	N	N	L	E	T	Y	E	W	Y
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	K	S	I	S	R	D	K	A	E	K	L	L	L	D	T	G	K	E	G	A	F	M	V	R	D	S	R	T	A	G	T	Y	T	V	S	V	F	T	K	A	V	V	S	E	N	N	P	C	I	K	H	Y	H	I	K	E	T	N	D	N	P	K	R	Y	Y	V	A	E	K	Y	V	F	D	S	I	P	L	L	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	T	V	A	D	G	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									105	.	.	.	.	110	.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.		.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.
Query SS confidence																																																																		.
Query Sequence		N	Y	H	Q	H	N	G	G	G	L	V	T	R	L	R	Y	P	V	C	F	G	R	Q	K	A	P	V	T	A	G	L	R	Y	G	K	W	V	I	D	P	S	E	L	T	F	V	Q	E	I	G	S	G	Q	F	G	L	V	H	L	G	Y	W	L	N	.	K	D	K	V	A	I	K	T	I	R	E	G	A	M	S
Query Conservation																																																																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.											.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Q	V	T	M	N	E	F	E	Y	L	K	L	L	G	K	G	T	F	G	K	V	I	L	V	K	E	K	A	T	G	R	Y	Y	A	M	K	I	L	K	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T				T	T	S											T	T									T	T	T											.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																					112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.		.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																														.
Query SS confidence																																																																														.
Query Sequence		E	E	D	F	I	E	E	A	E	V	M	M	K	L	S	H	P	K	L	V	Q	L	Y	G	V	C	L	E	Q	A	P	I	C	L	V	F	E	F	M	E	H	G	C	L	S	D	Y	L	R	T	Q	R	G	L	F	A	A	E	T	L	L	G	M	C	L	D	V	C	E	G	M	A	Y	L	E	E	.	A	C	V
Query Conservation																																																																														.
Alig confidence		.																																																					.																							.
Template Conservation		.																																																					.
Template Sequence		.	K	E	V	I	V	A	N	R	V	L	Q	N	S	R	H	P	F	L	T	A	L	K	Y	S	F	Q	T	H	D	R	L	C	F	V	M	E	Y	A	N	G	G	E	L	F	F	H	L	S	R	E	R	V	.	F	S	E	D	R	A	R	F	Y	G	A	E	I	V	S	A	L	D	Y	L	H	S	E	K	N	V
Template Known Secondary structure		.	G	G	G	S					G	G	G	T	S			T	T	B										S	S										S	S		B									S	S	.																							T	S
Template Predicted Secondary structure		.																																																					.
Template SS confidence
			183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.		.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	H	R	D	L	A	A	R	N	C	L	V	G	E	N	Q	V	I	K	V	S	D	F	G	M	T	R	F	V	L	D	D	Q	Y	T	S	S	T	G	T	K	F	P	V	K	W	A	S	P	E	V	F	S	F	S	R	Y	S	S	K	S	D	V	W	S	F	G	V	L	M	W	E	V	F	S	E	G	K	I	P
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template Sequence		V	Y	R	D	L	K	L	E	N	L	M	L	D	K	D	G	H	I	K	I	T	D	F	G	L	C	K	E	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	A	P	E	V	L	E	D	N	D	Y	G	R	A	V	D	W	W	G	L	G	V	V	M	Y	E	M	M	C	.	G	R	L	P
Template Known Secondary structure								G	G	G					T	T	S									S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S						T	T					T																	.	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300																.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330		.	.	.	.
		559	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.						.	.	.	.	.	.	.	610
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	E	N	R	S	N	S	E	V	V	E	D	I	S	T	G	F	R	L	Y	K	P	R	L	A	S	T	H	V	Y	Q	I	M	N	H	C	W	K	E	R	P	E	D	R	.	.	.	.	.	P	A	F	S	R	L	L	R
Query Conservation																																														.	.	.	.	.
Alig confidence																			.																											.	.	.	.	.
Template Conservation																			.
Template Sequence		F	Y	N	Q	D	H	E	K	L	F	E	L	I	L	M	E	E	.	I	R	F	P	R	T	L	G	P	E	A	K	S	L	L	S	G	L	L	K	K	D	P	K	Q	R	L	G	G	G	S	E	D	A	K	E	I	M	Q
Template Known Secondary structure		S			S	S													.					T	T													T		S	S	T	T	T	S	T	T		S	T	T	T						T
Template Predicted Secondary structure																			.
Template SS confidence
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.		.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.