Phyre 2 Results for A0PJM3

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	A0PJM3
Date	Tue Apr 3 14:51:25 BST 2012
Unique Job ID	c4985a30697b406b

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M L R A T A P C W F P P G Y P E A K K V A E E A A L E A P E F P L P S H Q P A Q S F G L W V P Q M H K Q A S A F V D I Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence A E P Q N R G P A V P P A W P K M V T E S C Y F P A Q R G S A C R L P A A P R L T E R P S G V R I S A P R K R K T I A H

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence S S S P C L V T G Y T D A K R T R V A S S S Q R S R G S K V G R Q P G K T R N R S G M A C K T T A T T S S K R I V R R A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence S L P S L S L K K P I I L R S S G C Q V P T V L R R G Y L Q L F T E E C L K F C A S K Q E A E E K A L N E E K V A Y D C

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence S P N K N R Y L N V V L N T L K R L K G L T P S S M P G L S R A A L Y S R L Q E F L L T Q D Q L K E N G Y P F P H P E R

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence P G G A V L F T G Q G K G P G D S S C R V C C R C G T E Y L V S S S G R C V R D Q L C Y Y H W G R V R S S Q V A G G R V

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence S Q Y T C C A A A P G S V G C Q V A K Q H V R D G R K E S L D G F V E T F K K E L S R D A Y P G I Y A L D C E M C Y T T

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ?
?
?
? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence H G L E L T R V T V V D A D M R V V Y D T F V K P D N E I V D Y N T R F S G V T E A D V A K T S I T L P Q V Q A I L L S

Secondary structure

SS confidence

Disorder

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence F F S A Q T I L I G H S L E S D L L A L K L I H S T V V D T A V L F P H Y L G F P Y K R S L R N L A A D Y L A Q I I Q D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . .

Sequence S Q D G H N S S E D A N A C L Q L V M W K V R Q R A Q I Q P R H R S A S P A A L A C P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand