![]() |
| ||||||||||||||||||||||||
|   | Insertion relative to template |
|   | Deletion relative to template |
|   | Catalytic residue from the CSA |
|   | |
| Detailed help on interpreting your alignment | |
|   |   | 8 | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | |
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | S | S | D | R | S | A | W | Y | M | G | P | V | S | R | Q | E | A | Q | T | R | L | Q | G | Q | R | H | G | M | F | L | V | R | D | S | S | T | C | . | P | G | D | Y | V | L | S | V | S | E | N | S | R | V | S | H | Y | I | I | N | S | L | P | N | R | R | F | K | I | G | D | Q | E | F | D | H | L | P | A | L | L | E |
| Template Sequence |   | S | L | Q | N | A | E | W | Y | W | G | D | I | S | R | E | E | V | N | E | K | L | R | D | T | A | D | G | T | F | L | V | R | D | A | S | T | K | M | H | G | D | Y | T | L | T | L | R | K | G | G | N | N | K | L | I | K | I | F | H | R | D | G | K | Y | G | F | S | D | P | L | T | F | S | S | V | V | E | L | I | N |
| Template Known Secondary structure |   | S | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | B | G | G | G | B | S | S | S | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 327 | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . |
|   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 87 | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | F | Y | K | I | H | Y | L | D | . | . | T | T | T | L | I | E | P | A | P | R | Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Sequence |   | H | Y | L | A | Q | Y | N | P | K | L | D | V | K | L | L | Y | P | V | S | K | Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Known Secondary structure |   | T | S | S | T | T | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 407 | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 420 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |
| Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
| Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
| Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
|   | ||||||||
|
| |||||||