Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0AVF1 Date Sat Jun 16 10:27:57 BST 2012 Unique Job ID a988f912b3359d4b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	M	L	S	R	A	K	P	A	V	G	R	G	V	Q	H	T	D	K	R	K	K	K	G	R	K	I	P	K	L	E	E	L	L	S	K	R	D	F	T	G	A	I	T	L	L	E	F	K	R	H	V	G	E	E	E	E	D	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	W	I	G	Y	C	A	F	H	L	G	D	Y	K	R	A	L	E	E	Y	E	N	A	T	K	E	E	N	C	N	S	E	V	W	V	N	L	A	C	T	Y	F	F	L	G	M	Y	K	Q	A	E	A	A	G	F	K	A	S	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	L	Q	N	R	L	L	F	H	L	A	H	K	F	N	D	E	K	K	L	M	S	F	H	Q	N	L	Q	D	V	T	E	D	Q	L	S	L	A	S	I	H	Y	M	R	S	H	Y	Q	E	A	I	D	I	Y	K	R	I	L	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	R	E	Y	L	A	L	N	V	Y	V	A	L	C	Y	Y	K	L	D	Y	Y	D	V	S	Q	E	V	L	A	V	Y	L	Q	Q	I	P	D	S	T	I	A	L	N	L	K	A	C	N	H	F	R	L	Y	N	G	R	A	A	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	L	K	S	L	M	D	N	A	S	S	S	F	E	F	A	K	E	L	I	R	H	N	L	V	V	F	R	G	G	E	G	A	L	Q	V	L	P	P	L	V	D	V	I	P	E	A	R	L	N	L	V	I	Y	Y	L	R	Q	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	Q	E	A	Y	N	L	I	K	D	L	E	P	T	T	P	Q	E	Y	I	L	K	G	V	V	N	A	A	L	G	Q	E	M	G	S	R	D	H	M	K	I	A	Q	Q	F	F	Q	L	V	G	G	S	A	S	E	C	D	T	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?		?																	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	R	Q	C	M	A	S	C	F	F	L	L	K	Q	F	D	D	V	L	I	Y	L	N	S	F	K	S	Y	F	Y	N	D	D	I	F	N	F	N	Y	A	Q	A	K	A	A	T	G	N	T	S	E	G	E	E	A	F	L	L	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	E	K	M	K	N	D	Y	I	Y	L	S	W	L	A	R	C	Y	I	M	N	K	K	P	R	L	A	W	E	L	Y	L	K	M	E	T	S	G	E	S	F	S	L	L	Q	L	I	A	N	D	C	Y	K	M	G	Q	F	Y	Y	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	K	A	F	D	V	L	E	R	L	D	P	N	P	E	Y	W	E	G	K	R	G	A	C	V	G	I	F	Q	M	I	I	A	G	R	E	P	K	E	T	L	R	E	V	L	H	L	L	R	S	T	G	N	T	Q	V	E	Y	M	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?												?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
Sequence		R	I	M	K	K	W	A	K	E	N	R	V	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand