Phyre 2 Results for Q01804

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	Q01804
Date	Wed Jun 6 09:57:10 BST 2012
Unique Job ID	a723a9e39fe1c18d

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M E A A V G V P D G G D Q G G A G P R E D A T P M D A Y L R K L G L Y R K L V A K D G S C L F R A V A E Q V L H S Q S R

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence H V E V R M A C I H Y L R E N R E K F E A F I E G S F E E Y L K R L E N P Q E W V G Q V E I S A L S L M Y R K D F I I Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence R E P N V S P S Q V T E N N F P E K V L L C F S N G N H Y D I V Y P I K Y K E S S A M C Q S L L Y E L L Y E K V F K T D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
? ? ?
? ?
? ?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence V S K I V M E L D T L E V A D E D N S E I S D S E D D S C K S K T A A A A A D V N G F K P L S G N E L K N N G N S T S L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence P L S R K V L K S L N P A V Y R N V E Y E I W L K S K Q A Q Q K R D Y S I A A G L Q Y E V G D K C Q V R L D H N G K F L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence N A D V Q G I H S E N G P V L V E E L G K K H T S K N L K A P P P E S W N T V S G K K M K K P S T S G Q N F H S D V D Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?
?
?
? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence R G P K N P S K P I K A P S A L P P R L Q H P S G V R Q H A F S S H S S G S Q S Q K F S S E H K N L S R T P S Q I I R K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence P D R E R V E D F D H T S R E S N Y F G L S P E E R R E K Q A I E E S R L L Y E I Q N R D E Q A F P A L S S S S V N Q S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence A S Q S S N P C V Q R K S S H V G D R K G S R R R M D T E E R K D K D S I H G H S Q L D K R P E P S T L E N I T D D K Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence A T V S S P S K S K K L E C P S P A E Q K P A E H V S L S N P A P L L V S P E V H L T P A V P S L P A T V P A W P S E P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence T T F G P T G V P A P I P V L S V T Q T L T T G P D S A V S Q A H L T P S P V P V S I Q A V N Q P L M P L P Q T L S L Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence Q D P L Y P G F P C N E K G D R A I V P P Y S L C Q T G E D L P K D K N I L R F F F N L G V K A Y S C P M W A P H S Y L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ?
? ? ?
?
?
?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence Y P L H Q A Y L A A C R M Y P K V P V P V Y P H N P W F Q E A P A A Q N E S D C T C T D A H F P M Q T E A S V N G Q M P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence Q P E I G P P T F S S P L V I P P S Q V S E S H G Q L S Y Q A D L E S E T P G Q L L H A D Y E E S L S G K N M F P Q P S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence F G P N P F L G P V P I A P P F F P H V W Y G Y P F Q G F I E N P V M R Q N I V L P S D E K G E L D L S L E N L D L S K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence D C G S V S T V D E F P E A R G E H V H S L P E A S V S S K P D E G R T E Q S S Q T R K A D T A L A S I P P V A E G K A

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence H P P T Q I L N R E R E T V P V E L E P K R T I Q S L K E K T E K V K D P K T A A D V V S P G A N S V D S R V Q R P K E

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence E S S E D E N E V S N I L R S G R S K Q F Y N Q T Y G S R K Y K S D W G Y S G R G G Y Q H V R S E E S W K G Q P S R S R

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ?
?
?
?
? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . .

Sequence D E G Y Q Y H R N V R G R P F R G D R R R S G M G D G H R G Q H T

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ?
?
? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand