Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P51451 Date Wed May 9 17:30:27 BST 2012 Unique Job ID 9e80e73333c4189d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	G	L	V	S	S	K	K	P	D	K	E	K	P	I	K	E	K	D	K	G	Q	W	S	P	L	K	V	S	A	Q	D	K	D	A	P	P	L	P	P	L	V	V	F	N	H	L	T	P	P	P	P	D	E	H	L	D	E	D	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		H	F	V	V	A	L	Y	D	Y	T	A	M	N	D	R	D	L	Q	M	L	K	G	E	K	L	Q	V	L	K	G	T	G	D	W	W	L	A	R	S	L	V	T	G	R	E	G	Y	V	P	S	N	F	V	A	R	V	E	S	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?																								?	?											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	E	R	W	F	F	R	S	Q	G	R	K	E	A	E	R	Q	L	L	A	P	I	N	K	A	G	S	F	L	I	R	E	S	E	T	N	K	G	A	F	S	L	S	V	K	D	V	T	T	Q	G	E	L	I	K	H	Y	K	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?			?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		C	L	D	E	G	G	Y	Y	I	S	P	R	I	T	F	P	S	L	Q	A	L	V	Q	H	Y	S	K	K	G	D	G	L	C	Q	R	L	T	L	P	C	V	R	P	A	P	Q	N	P	W	A	Q	D	E	W	E	I	P	R	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?		?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	R	L	V	R	K	L	G	S	G	Q	F	G	E	V	W	M	G	Y	Y	K	N	N	M	K	V	A	I	K	T	L	K	E	G	T	M	S	P	E	A	F	L	G	E	A	N	V	M	K	A	L	Q	H	E	R	L	V	R	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																											?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	V	V	T	K	E	P	I	Y	I	V	T	E	Y	M	A	R	G	C	L	L	D	F	L	K	T	D	E	G	S	R	L	S	L	P	R	L	I	D	M	S	A	Q	I	A	E	G	M	A	Y	I	E	R	M	N	S	I	H	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	R	A	A	N	I	L	V	S	E	A	L	C	C	K	I	A	D	F	G	L	A	R	I	I	D	S	E	Y	T	A	Q	E	G	A	K	F	P	I	K	W	T	A	P	E	A	I	H	F	G	V	F	T	I	K	A	D	V	W	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	G	V	L	L	M	E	V	V	T	Y	G	R	V	P	Y	P	G	M	S	N	P	E	V	I	R	N	L	E	R	G	Y	R	M	P	R	P	D	T	C	P	P	E	L	Y	R	G	V	I	A	E	C	W	R	S	R	P	E	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?		?	?	?				?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
Sequence		P	T	F	E	F	L	Q	S	V	L	E	D	F	Y	T	A	T	E	R	Q	Y	E	L	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand