Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0MZ66 Date Sat Jun 16 10:26:01 BST 2012 Unique Job ID 9a279396d7ab0d93

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	S	S	D	E	E	K	Q	L	Q	L	I	T	S	L	K	E	Q	A	I	G	E	Y	E	D	L	R	A	E	N	Q	K	T	K	E	K	C	D	K	I	R	Q	E	R	D	E	A	V	K	K	L	E	E	F	Q	K	I	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	V	I	E	E	V	N	F	M	Q	N	H	L	E	I	E	K	T	C	R	E	S	A	E	A	L	A	T	K	L	N	K	E	N	K	T	L	K	R	I	S	M	L	Y	M	A	K	L	G	P	D	V	I	T	E	E	I	N	I	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	E	D	S	T	T	D	T	D	G	A	A	E	T	C	V	S	V	Q	C	Q	K	Q	I	K	E	L	R	D	Q	I	V	S	V	Q	E	E	K	K	I	L	A	I	E	L	E	N	L	K	S	K	L	V	E	V	I	E	E	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	V	K	Q	E	K	T	V	L	N	S	E	V	L	E	Q	R	K	V	L	E	K	C	N	R	V	S	M	L	A	V	E	E	Y	E	E	M	Q	V	N	L	E	L	E	K	D	L	R	K	K	A	E	S	F	A	Q	E	M	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	Q	N	K	L	K	R	Q	S	H	L	L	L	Q	S	S	I	P	D	Q	Q	L	L	K	A	L	D	E	N	A	K	L	T	Q	Q	L	E	E	E	R	I	Q	H	Q	Q	K	V	K	E	L	E	E	Q	L	E	N	E	T	L	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	E	I	H	N	L	K	Q	Q	L	E	L	L	E	E	D	K	K	E	L	E	L	K	Y	Q	N	S	E	E	K	A	R	N	L	K	H	S	V	D	E	L	Q	K	R	V	N	Q	S	E	N	S	V	P	P	P	P	P	P	P	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	L	P	P	P	P	P	N	P	I	R	S	L	M	S	M	I	R	K	R	S	H	P	S	G	S	G	A	K	K	E	K	A	T	Q	P	E	T	T	E	E	V	T	D	L	K	R	Q	A	V	E	E	M	M	D	R	I	K	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	H	L	R	P	V	N	Q	T	A	R	P	K	T	K	P	E	S	S	K	G	C	E	S	A	V	D	E	L	K	G	I	L	G	T	L	N	K	S	T	S	S	R	S	L	K	S	L	D	P	E	N	S	E	T	E	L	E	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?		?					?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	R	R	R	K	V	T	A	E	A	D	S	S	S	P	T	G	I	L	A	T	S	E	S	K	S	M	P	V	L	G	S	V	S	S	V	T	K	T	A	L	N	K	K	T	L	E	A	E	F	N	S	P	S	P	P	T	P	E	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		G	E	G	P	R	K	L	E	G	C	T	S	S	K	V	T	F	Q	P	P	S	S	I	G	C	R	K	K	Y	I	D	G	E	K	Q	A	E	P	V	V	V	L	D	P	V	S	T	H	E	P	Q	T	K	D	Q	V	A	E	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?			?					?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.
Sequence		P	T	Q	H	K	E	D	E	G	E	I	Q	P	E	N	K	E	D	S	I	E	N	V	R	E	T	D	S	S	N	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand