Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0PJY2 Date Fri May 25 09:29:34 BST 2012 Unique Job ID 993c879d1f628d04

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	S	S	C	H	N	A	T	T	K	M	L	A	T	A	P	A	R	G	N	M	M	S	T	S	K	P	L	A	F	S	I	E	R	I	M	A	R	T	P	E	P	K	A	L	P	V	P	H	F	L	Q	G	A	L	P	K	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	K	H	S	L	H	L	N	S	S	I	P	C	M	I	P	F	V	P	V	A	Y	D	T	S	P	K	A	G	V	T	G	S	E	P	R	K	A	S	L	E	A	P	A	A	P	A	A	V	P	S	A	P	A	F	S	C	S	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?			?		?				?	?	?	?	?	?	?	?	?		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	N	C	A	L	S	L	K	G	D	L	A	R	D	A	L	P	L	Q	Q	Y	K	L	V	R	P	R	V	V	N	H	S	S	F	H	A	M	G	A	L	C	Y	L	N	R	G	D	G	P	C	H	P	A	A	G	V	N	I	H	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?									?		?																						?	?	?		?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	A	S	Y	F	L	S	S	P	L	H	P	Q	P	K	T	Y	L	A	E	R	N	K	L	V	V	P	A	V	E	K	Y	P	S	G	V	A	F	K	D	L	S	Q	A	Q	L	Q	H	Y	M	K	E	S	A	Q	L	L	S	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?		?	?	?	?	?	?	?	?		?		?					?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	A	F	K	T	S	D	F	S	R	G	S	P	N	A	K	P	K	V	F	T	C	E	V	C	G	K	V	F	N	A	H	Y	N	L	T	R	H	M	P	V	H	T	G	A	R	P	F	V	C	K	V	C	G	K	G	F	R	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	T	L	C	R	H	K	I	I	H	T	Q	E	K	P	H	K	C	N	Q	C	G	K	A	F	N	R	S	S	T	L	N	T	H	T	R	I	H	A	G	Y	K	P	F	V	C	E	F	C	G	K	G	F	H	Q	K	G	N	Y	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	H	K	L	T	H	S	G	E	K	Q	F	K	C	N	I	C	N	K	A	F	H	Q	V	Y	N	L	T	F	H	M	H	T	H	N	D	K	K	P	F	T	C	P	T	C	G	K	G	F	C	R	N	F	D	L	K	K	H	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Sequence		K	L	H	D	S	S	L	G	L	A	R	T	P	A	G	E	P	G	T	E	P	P	P	P	L	P	Q	Q	P	P	M	T	L	P	P	L	Q	P	P	L	P	T	P	G	P	L	Q	P	G	L	H	Q	G	H	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?		?									?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand