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|   | Insertion relative to template |
|   | Deletion relative to template |
|   | Catalytic residue from the CSA |
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| Detailed help on interpreting your alignment | |
|   |   | 1016 | . | . | . | 1020 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1030 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1040 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1050 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1060 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1070 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1080 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1090 | . | . | . | . | |
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | S | S | F | S | T | A | R | S | A | A | A | E | A | K | G | R | L | A | E | R | A | A | S | Q | G | S | D | S | P | L | L | P | A | Q | R | N | S | I | P | V | S | P | V | R | P | K | P | I | E | K | S | Q | F | I | H | N | N | L | K | D | V | Y | V | S | I | A | D | Y | E | G | . | D | E | E | T | A | G | F | Q | E |
| Template Sequence |   | G | S | S | G | S | S | G | R | L | L | D | L | E | N | I | Q | I | P | D | A | P | P | P | I | P | K | E | P | S | N | Y | D | F | S | G | P | S | S | G | I | E | G | R | G | S | S | G | S | S | G | S | S | G | S | S | G | D | K | E | R | H | G | V | A | I | Y | N | F | Q | G | S | G | A | P | Q | L | S | L | Q | I |
| Template Known Secondary structure |   | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | B | S | B | S | T | T | B | B | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 |
|   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 1095 | . | . | . | . | 1100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1130 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | G | V | S | M | E | V | L | E | R | N | P | N | G | W | W | Y | C | Q | I | L | D | G | V | K | P | F | K | G | W | V | P | S | N | Y | L | E | K | K | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Sequence |   | G | D | V | V | R | I | Q | E | T | C | G | D | W | Y | R | G | Y | L | I | K | H | K | M | . | . | L | Q | G | I | F | P | K | S | F | I | H | I | K | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Known Secondary structure |   | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | T | T | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | G | G | G | B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 81 | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
| Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
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