Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q8N427 Date Wed Jun 6 09:55:08 BST 2012 Unique Job ID 7fd6079845d00443

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	S	K	K	R	E	V	Q	L	Q	T	V	I	N	N	Q	S	L	W	D	E	M	L	Q	N	K	G	L	T	V	I	D	V	Y	Q	A	W	C	G	P	C	R	A	M	Q	P	L	F	R	K	L	K	N	E	L	N	E	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	L	H	F	A	V	A	E	A	D	N	I	V	T	L	Q	P	F	R	D	K	C	E	P	V	F	L	F	S	V	N	G	K	I	I	E	K	I	Q	G	A	N	A	P	L	V	N	K	K	V	I	N	L	I	D	E	E	R	K	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																																						?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	A	G	E	M	A	R	P	Q	Y	P	E	I	P	L	V	D	S	D	S	E	V	S	E	E	S	P	C	E	S	V	Q	E	L	Y	S	I	A	I	I	K	P	D	A	V	I	S	K	K	V	L	E	I	K	R	K	I	T	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?			?	?		?		?	?																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	F	I	I	E	A	E	H	K	T	V	L	T	E	E	Q	V	V	N	F	Y	S	R	I	A	D	Q	C	D	F	E	E	F	V	S	F	M	T	S	G	L	S	Y	I	L	V	V	S	Q	G	S	K	H	N	P	P	S	E	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	P	Q	T	D	T	E	P	N	E	R	S	E	D	Q	P	E	V	E	A	Q	V	T	P	G	M	M	K	N	K	Q	D	S	L	Q	E	Y	L	E	R	Q	H	L	A	Q	L	C	D	I	E	E	D	A	A	N	V	A	K	F	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	A	F	F	P	D	F	K	K	M	K	S	M	K	L	E	K	T	L	A	L	L	R	P	N	L	F	H	E	R	K	D	D	V	L	R	I	I	K	D	E	D	F	K	I	L	E	Q	R	Q	V	V	L	S	E	K	E	A	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	C	K	E	Y	E	N	E	D	Y	F	N	K	L	I	E	N	M	T	S	G	P	S	L	A	L	V	L	L	R	D	N	G	L	Q	Y	W	K	Q	L	L	G	P	R	T	V	E	E	A	I	E	Y	F	P	E	S	L	C	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?																																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	A	M	D	S	L	P	V	N	Q	L	Y	G	S	D	S	L	E	T	A	E	R	E	I	Q	H	F	F	P	L	Q	S	T	L	G	L	I	K	P	H	A	T	S	E	Q	R	E	Q	I	L	K	I	V	K	E	A	G	F	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	Q	V	K	K	M	F	L	T	P	E	Q	I	E	K	I	Y	P	K	V	T	G	K	D	F	Y	K	D	L	L	E	M	L	S	V	G	P	S	M	V	M	I	L	T	K	W	N	A	V	A	E	W	R	R	L	M	G	P	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	E	E	A	K	L	L	S	P	D	S	I	R	A	Q	F	G	I	S	K	L	K	N	I	V	H	G	A	S	N	A	Y	E	A	K	E	V	V	N	R	L	F	E	D	P	E	E	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?																																			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand