Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A1A5C7 Date Wed May 9 18:02:57 BST 2012 Unique Job ID 7e23fddf87cb6512

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	I	D	R	R	R	E	A	A	G	G	G	P	G	R	Q	P	A	P	A	E	E	N	G	S	L	P	P	G	D	A	A	A	S	A	P	L	G	G	R	A	G	P	G	G	G	A	E	I	Q	P	L	P	P	L	H	P	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	P	H	P	S	C	C	S	A	A	A	A	P	S	L	L	L	L	D	Y	D	G	S	V	L	P	F	L	G	G	L	G	G	G	Y	Q	K	T	L	V	L	L	T	W	I	P	A	L	F	I	G	F	S	Q	F	S	D	S	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	D	Q	P	N	F	W	C	R	G	A	G	K	G	T	E	L	A	G	V	T	T	T	G	R	G	G	D	M	G	N	W	T	S	L	P	T	T	P	F	A	T	A	P	W	E	A	A	G	N	R	S	N	S	S	G	A	D	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?		?			?	?			?	?	?		?		?	?	?	?	?	?	?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	T	P	P	L	P	S	P	P	D	K	G	D	N	A	S	N	C	D	C	R	A	W	D	Y	G	I	R	A	G	L	V	Q	N	V	V	S	K	W	D	L	V	C	D	N	A	W	K	V	H	I	A	K	F	S	L	L	V	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	F	G	Y	L	I	T	G	C	I	A	D	W	V	G	R	R	P	V	L	L	F	S	I	I	F	I	L	I	F	G	L	T	V	A	L	S	V	N	V	T	M	F	S	T	L	R	F	F	E	G	F	C	L	A	G	I	I	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	Y	A	L	R	I	E	L	C	P	P	G	K	R	F	M	I	T	M	V	A	S	F	V	A	M	A	G	Q	F	L	M	P	G	L	A	A	L	C	R	D	W	Q	V	L	Q	A	L	I	I	C	P	F	L	L	M	L	L	Y	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	I	F	P	E	S	L	R	W	L	M	A	T	Q	Q	F	E	S	A	K	R	L	I	L	H	F	T	Q	K	N	R	M	N	P	E	G	D	I	K	G	V	I	P	E	L	E	K	E	L	S	R	R	P	K	K	V	C	I	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?													?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	V	G	T	R	N	L	W	K	N	I	V	V	L	C	V	N	S	L	T	G	Y	G	I	H	H	C	F	A	R	S	M	M	G	H	E	V	K	V	P	L	L	E	N	F	Y	A	D	Y	Y	T	T	A	S	I	A	L	V	S	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	A	M	C	V	V	V	R	F	L	G	R	R	G	G	L	L	L	F	M	I	L	T	A	L	A	S	L	L	Q	L	G	L	L	N	L	I	G	K	Y	S	Q	H	P	D	S	G	M	S	D	S	V	K	D	K	F	S	I	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	I	V	G	M	F	A	S	H	A	V	G	S	L	S	V	F	F	C	A	E	I	T	P	T	V	I	R	C	G	G	L	G	L	V	L	A	S	A	G	F	G	M	L	T	A	P	I	I	E	L	H	N	Q	K	G	Y	F	L	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		H	I	I	F	A	C	C	T	L	I	C	I	I	C	I	L	L	L	P	E	S	R	D	Q	N	L	P	E	N	I	S	N	G	E	H	Y	T	R	Q	P	L	L	P	H	K	K	G	E	Q	P	L	L	L	T	N	A	E	L	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.
Sequence		Y	S	G	L	H	D	A	A	A	A	G	D	T	L	P	E	G	A	T	A	N	G	M	K	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand