Job Description P42681 Confidence 100.00% Date Thu Apr 26 09:52:37 BST 2012 Rank 10 Aligned Residues 413 % Identity 23% Template c3pfqA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:protein kinase c beta type; PDBTitle: crystal structure and allosteric activation of protein kinase c beta2 ii Resolution 4.00 Å

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	I	Q	S	V	F	C	C	C	C	C	C	S	V	Q	K	R	Q	M	R	T	Q	I	S	L	S	T	D	E	E	L	P	E	K	Y	T	Q	R	R	R	P	W	L	S	Q	L	S	N	K	K	Q	S	N	T	G	R	V	Q	P	S	K	R	K	P	L	P	P	L	P	P	S	E	V	A	E	E	K	I	Q	V
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.
Template Sequence		I	H	Q	G	M	K	C	D	T	C	M	M	N	V	H	K	R	C	V	M	N	V	P	S	L	C	G	T	D	.	.	.	.	.	.	H	T	E	R	R	G	R	I	Y	I	Q	A	H	I	D	R	E	V	L	I	V	V	V	R	D	A	K	N	L	V	P	M	D	P	N	G	L	S	D	P	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S						S	S	S				B		S	S	T	T	S	S	S				S	S	S		.	.	.	.	.	.	S	S			S											S	S											S					S	T	T	S	S				.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.							.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	L	Y	D	F	L	P	R	E	P	C	N	L	A	L	R	R	A	E	E	Y	L	I	L	E	K	Y	N	P	H	W	W	K	A	R	D	R	L	G	N	E	G	L	I	P	S	N	Y	V	T	E	N	K	I	T	N	L	E	I	Y	E	W	Y	H	R	N	I	T	R	N	Q	A	E	H	L	L	R	Q	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.							.																													.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.							.																													.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	Y	V	K	L	K	L	I	P	D	P	K	S	E	S	K	Q	K	T	K	T	I	K	S	S	L	N	P	E	W	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	T	F	R	F	.	Q	L	K	E	S	D	K	D	R	R	L	S	V	E	I	W	D	W	D	L	T	S	R	N	D	F	M	G	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.								S		S	S			S								S	S		S	S				.	.	.	.	.	.	.	.							.				S	T	T	T	T												S	S	S							.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.							.																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
					195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.									.	.	.	.	.	.		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	K	E	G	A	F	I	V	R	D	S	R	H	L	G	S	Y	T	I	S	V	F	M	G	A	R	R	S	T	E	A	A	I	K	H	Y	Q	I	K	K	N	D	S	G	Q	W	Y	V	A	E	R	H	A	F	Q	S	I	P	E	L	I	W	Y	H	Q	H	N	A	A	G	L	M	T	R	L	R	Y	P	V	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	S	F	G	I	S	E	L	Q	K	A	G	V	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B				B	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																			258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.		.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.					.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																														.													.	.	.	.																			.
Query SS confidence																																														.													.	.	.	.																			.
Query Sequence		L	M	G	S	C	L	P	A	T	A	G	F	S	Y	E	K	W	E	I	D	P	S	E	L	A	F	I	K	E	I	G	S	G	Q	F	G	V	V	H	L	G	E	W	R	.	S	H	I	Q	V	A	I	K	A	I	N	E	.	.	.	.	G	S	M	S	E	E	D	F	I	E	E	A	K	V	M	M	K	L	.
Query Conservation																																														.													.	.	.	.																			.
Alig confidence																																														.													.	.	.	.																			.
Template Conservation
Template Sequence		G	W	F	K	L	L	S	Q	E	E	G	E	Y	F	N	V	P	V	P	P	L	T	D	F	N	F	L	M	V	L	G	K	G	S	F	G	K	V	M	L	S	E	R	K	G	T	D	E	L	Y	A	V	K	I	L	K	K	D	V	V	I	Q	D	D	D	V	E	C	T	M	V	E	K	R	V	L	A	L	P	G
Template Known Secondary structure							B		T	T	G	G	G	T									T	T							S	S	B	T	T	T	B								S	S	S																	T	T	T	T											T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	H	S	K	L	V	Q	L	Y	G	V	C	I	Q	R	K	P	L	Y	I	V	T	E	F	M	E	N	G	C	L	L	N	Y	L	R	E	N	K	G	K	L	R	K	E	M	L	L	S	V	C	Q	D	I	C	E	G	M	E	Y	L	E	R	N	G	Y	I	H	R	D	L	A	A	R	N	C	L	V	S	S	T
Query Conservation
Alig confidence																																							.
Template Conservation																																							.
Template Sequence		K	P	P	F	L	T	Q	L	H	S	C	F	Q	T	M	D	R	L	Y	F	V	M	E	Y	V	N	G	G	D	L	M	Y	H	I	Q	Q	V	.	G	R	F	K	E	P	H	A	V	F	Y	A	A	E	I	A	I	G	L	F	F	L	Q	S	K	G	I	I	Y	R	D	L	K	L	D	N	V	M	L	D	S	E
Template Known Secondary structure				T	T	B								B		S	S											S		B									.	S	S																							T	S								S	T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure																																							.
Template SS confidence
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	I	V	K	I	S	D	F	G	M	T	R	Y	V	L	D	D	E	Y	V	S	S	F	G	A	K	F	P	I	K	W	S	P	P	E	V	F	L	F	N	K	Y	S	S	K	S	D	V	W	S	F	G	V	L	M	W	E	V	F	T	E	G	K	M	P	F	E	N	K	S	N	L	Q	V	V	E	A	I	S	E
Query Conservation
Alig confidence																									.	.																																				.
Template Conservation																									.	.																																				.
Template Sequence		G	H	I	K	I	A	D	F	G	M	C	K	E	N	I	W	D	G	V	T	T	K	F	.	.	C	G	T	P	D	Y	I	A	P	E	I	I	A	Y	Q	P	Y	G	K	S	V	D	W	W	A	F	G	V	L	L	Y	E	M	L	A	.	G	Q	A	P	F	E	G	E	D	E	D	E	L	F	Q	S	I	M	E
Template Known Secondary structure		S								T	T							T	T			B			.	.		S		S	S	S							T				B	S	T																	.	S	S		S	S			S	S										S
Template Predicted Secondary structure																									.	.																																				.
Template SS confidence
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500			.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.		.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.						.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	R	L	Y	R	P	H	L	A	P	M	S	I	Y	E	V	M	Y	S	C	W	H	E	K	P	E	G	R	P	T	.	.	.	.	.	F	A	E	L	L	R
Query Conservation																																	.	.	.	.	.
Alig confidence			.																														.	.	.	.	.
Template Conservation			.
Template Sequence		H	.	N	V	A	Y	P	K	S	M	S	K	E	A	V	A	I	C	K	G	L	M	T	K	H	P	G	K	R	L	G	C	G	P	E	G	E	R	D	I	K	E
Template Known Secondary structure		S	.						T	T	S												S		S	S	S	T	T		T	T		S	T	T							S
Template Predicted Secondary structure			.
Template SS confidence
		556		.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.