Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P16885 Date Sat Jun 16 10:20:27 BST 2012 Unique Job ID 6f2623cc6c83566a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	T	T	V	N	V	D	S	L	A	E	Y	E	K	S	Q	I	K	R	A	L	E	L	G	T	V	M	T	V	F	S	F	R	K	S	T	P	E	R	R	T	V	Q	V	I	M	E	T	R	Q	V	A	W	S	K	T	A	D	K
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?																					?	?	?	?
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Sequence		I	E	G	F	L	D	I	M	E	I	K	E	I	R	P	G	K	N	S	K	D	F	E	R	A	K	A	V	R	Q	K	E	D	C	C	F	T	I	L	Y	G	T	Q	F	V	L	S	T	L	S	L	A	A	D	S	K	E	D	A	V
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Disorder																			?	?						?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	W	L	S	G	L	K	I	L	H	Q	E	A	M	N	A	S	T	P	T	I	I	E	S	W	L	R	K	Q	I	Y	S	V	D	Q	T	R	R	N	S	I	S	L	R	E	L	K	T	I	L	P	L	I	N	F	K	V	S	S	A
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Disorder																	?	?	?																	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	F	L	K	D	K	F	V	E	I	G	A	H	K	D	E	L	S	F	E	Q	F	H	L	F	Y	K	K	L	M	F	E	Q	Q	K	S	I	L	D	E	F	K	K	D	S	S	V	F	I	L	G	N	T	D	R	P	D	A	S	A
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Disorder													?	?	?	?	?		?																	?																					?		?	?
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Sequence		V	Y	L	H	D	F	Q	R	F	L	I	H	E	Q	Q	E	H	W	A	Q	D	L	N	K	V	R	E	R	M	T	K	F	I	D	D	T	M	R	E	T	A	E	P	F	L	F	V	D	E	F	L	T	Y	L	F	S	R	E	N	S
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Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		I	W	D	E	K	Y	D	A	V	D	M	Q	D	M	N	N	P	L	S	H	Y	W	I	S	S	S	H	N	T	Y	L	T	G	D	Q	L	R	S	E	S	S	P	E	A	Y	I	R	C	L	R	M	G	C	R	C	I	E	L	D	C
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		W	D	G	P	D	G	K	P	V	I	Y	H	G	W	T	R	T	T	K	I	K	F	D	D	V	V	Q	A	I	K	D	H	A	F	V	T	S	S	F	P	V	I	L	S	I	E	E	H	C	S	V	E	Q	Q	R	H	M	A	K	A
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Disorder
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Sequence		F	K	E	V	F	G	D	L	L	L	T	K	P	T	E	A	S	A	D	Q	L	P	S	P	S	Q	L	R	E	K	I	I	I	K	H	K	K	L	G	P	R	G	D	V	D	V	N	M	E	D	K	K	D	E	H	K	Q	Q	G	E
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Disorder																	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?				?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		L	Y	M	W	D	S	I	D	Q	K	W	T	R	H	Y	C	A	I	A	D	A	K	L	S	F	S	D	D	I	E	Q	T	M	E	E	E	V	P	Q	D	I	P	P	T	E	L	H	F	G	E	K	W	F	H	K	K	V	E	K	R
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Disorder							?	?	?	?	?											?	?						?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?							?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	S	A	E	K	L	L	Q	E	Y	C	M	E	T	G	G	K	D	G	T	F	L	V	R	E	S	E	T	F	P	N	D	Y	T	L	S	F	W	R	S	G	R	V	Q	H	C	R	I	R	S	T	M	E	G	G	T	L	K	Y	Y
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Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		L	T	D	N	L	T	F	S	S	I	Y	A	L	I	Q	H	Y	R	E	T	H	L	R	C	A	E	F	E	L	R	L	T	D	P	V	P	N	P	N	P	H	E	S	K	P	W	Y	Y	D	S	L	S	R	G	E	A	E	D	M	L
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Disorder																						?	?	?	?	?													?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		M	R	I	P	R	D	G	A	F	L	I	R	K	R	E	G	S	D	S	Y	A	I	T	F	R	A	R	G	K	V	K	H	C	R	I	N	R	D	G	R	H	F	V	L	G	T	S	A	Y	F	E	S	L	V	E	L	V	S	Y	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		E	K	H	S	L	Y	R	K	M	R	L	R	Y	P	V	T	P	E	L	L	E	R	Y	N	M	E	R	D	I	N	S	L	Y	D	V	S	R	M	Y	V	D	P	S	E	I	N	P	S	M	P	Q	R	T	V	K	A	L	Y	D	Y
Secondary structure
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Disorder							?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		K	A	K	R	S	D	E	L	S	F	C	R	G	A	L	I	H	N	V	S	K	E	P	G	G	W	W	K	G	D	Y	G	T	R	I	Q	Q	Y	F	P	S	N	Y	V	E	D	I	S	T	A	D	F	E	E	L	E	K	Q	I	I
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Disorder			?	?		?	?		?	?															?	?						?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		E	D	N	P	L	G	S	L	C	R	G	I	L	D	L	N	T	Y	N	V	V	K	A	P	Q	G	K	N	Q	K	S	F	V	F	I	L	E	P	K	Q	Q	G	D	P	P	V	E	F	A	T	D	R	V	E	E	L	F	E	W	F
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		Q	S	I	R	E	I	T	W	K	I	D	T	K	E	N	N	M	K	Y	W	E	K	N	Q	S	I	A	I	E	L	S	D	L	V	V	Y	C	K	P	T	S	K	T	K	D	N	L	E	N	P	D	F	R	E	I	R	S	F	V	E
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Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		T	K	A	D	S	I	I	R	Q	K	P	V	D	L	L	K	Y	N	Q	K	G	L	T	R	V	Y	P	K	G	Q	R	V	D	S	S	N	Y	D	P	F	R	L	W	L	C	G	S	Q	M	V	A	L	N	F	Q	T	A	D	K	Y
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SS confidence
Disorder																														?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		M	Q	M	N	H	A	L	F	S	L	N	G	R	T	G	Y	V	L	Q	P	E	S	M	R	T	E	K	Y	D	P	M	P	P	E	S	Q	R	K	I	L	M	T	L	T	V	K	V	L	G	A	R	H	L	P	K	L	G	R	S	I
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Disorder													?		?										?		?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?																		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		A	C	P	F	V	E	V	E	I	C	G	A	E	Y	D	N	N	K	F	K	T	T	V	V	N	D	N	G	L	S	P	I	W	A	P	T	Q	E	K	V	T	F	E	I	Y	D	P	N	L	A	F	L	R	F	V	V	Y	E	E	D
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SS confidence
Disorder																	?																																											?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		M	F	S	D	P	N	F	L	A	H	A	T	Y	P	I	K	A	V	K	S	G	F	R	S	V	P	L	K	N	G	Y	S	E	D	I	E	L	A	S	L	L	V	F	C	E	M	R	P	V	L	E	S	E	E	E	L	Y	S	S	C
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Disorder		?	?	?																													?																		?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		R	Q	L	R	R	R	Q	E	E	L	N	N	Q	L	F	L	Y	D	T	H	Q	N	L	R	N	A	N	R	D	A	L	V	K	E	F	S	V	N	E	N	Q	L	Q	L	Y	Q	E	K	C	N	K	R	L	R	E	K	R	V	S	N
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Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.
Sequence		S	K	F	Y	S
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Disorder		?	?	?	?	?
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