Job Description P16885 Confidence 100.00% Date Sat Jun 16 10:20:27 BST 2012 Rank 3 Aligned Residues 670 % Identity 35% Template c2fjuB_ PDB info PDB header:signaling protein,apoptosis/hydrolase Chain: B: PDB Molecule:1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate PDBTitle: activated rac1 bound to its effector phospholipase c beta 2 Resolution 2.20 Å

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		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Q	I	K	R	A	L	E	L	G	T	V	M	T	V	F	S	F	R	K	S	T	P	E	R	R	T	V	Q	V	I	M	E	T	R	Q	V	A	W	S	K	T	A	D	K	I	E	G	F	L	D	I	M	E	I	K	E	I	R	P	G	K	N	S	K	D	F	E	R	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																														.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.
Template Sequence		P	K	V	K	A	Y	L	S	Q	G	E	R	F	I	K	W	D	D	E	T	T	V	A	S	P	V	I	L	R	V	D	P	K	G	Y	Y	L	Y	W	T	Y	Q	S	K	.	E	M	E	F	L	D	I	T	S	I	R	D	T	R	F	G	K	F	A	K	M	P	K	S	Q	K	L	R	D	V	F	N	M	D	F
Template Known Secondary structure																		S	S	S	S	S											T	T	S								T	T	S	.							G	G	G							G	G	G	S					S							T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																														.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.		.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.		.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150			.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.																																															.	.
Query SS confidence																				.																																															.	.
Query Sequence		A	V	R	Q	K	E	D	C	C	F	T	I	L	Y	G	T	Q	F	.	V	L	S	T	L	S	L	A	A	D	S	K	E	D	A	V	N	W	L	S	G	L	K	I	L	H	Q	E	A	M	N	A	S	T	P	T	I	I	E	S	W	L	R	K	Q	I	.	.	Y	S	V	D	Q	T	R	R	N	S	I	S	L
Query Conservation																				.																																															.	.
Alig confidence																				.																																						.	.								.	.
Template Conservation																																																										.	.
Template Sequence		P	D	N	S	F	L	L	K	T	L	T	V	V	S	G	P	D	M	V	D	L	T	F	H	N	F	V	S	Y	K	E	N	V	G	K	A	W	A	E	D	V	L	A	L	V	K	H	P	L	T	A	N	A	S	R	S	.	.	T	F	L	D	K	I	L	V	K	L	K	M	Q	L	N	S	E	G	K	I	P	V
Template Known Secondary structure		T	T			G	G	G	T								S	S	S	S	S									S	S	S	S														T						T					.	.													S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.			.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.		.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																			.													.
Query SS confidence																			.													.
Query Sequence		R	E	L	K	T	I	L	P	L	I	N	F	K	V	S	S	A	.	K	F	L	K	D	K	F	V	E	I	G	A	.	H	K	D	E	L	S	F	E	Q	F	H	L	F	Y	K	K	L	M	F	E	Q	Q	K	S	I	L	D	E	F	K	K	D	S	S	V	F	I	L	G	N	T	D	R	P	D	A	S	A	V
Query Conservation																			.													.
Alig confidence																			.													.																		.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	N	F	F	Q	M	F	P	A	D	R	K	R	V	E	A	A	L	S	A	C	H	L	P	K	G	K	N	D	A	I	N	P	E	D	F	P	E	P	V	Y	K	S	F	L	M	S	L	.	.	C	P	R	P	E	I	D	E	I	F	T	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M
Template Known Secondary structure								S	T	T												T	T				S	S	S					G	G	G	S		T	T										.	.	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.			.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	L	H	D	F	Q	R	F	L	I	H	E	Q	Q	E	H	W	A	Q	D	L	N	K	V	R	E	R	M	T	K	F	I	D	D	T	M	R	E	T	A	E	P	F	L	F	V	D	E	F	L	T	Y	L	F	S	R	E	N	S	I	W	D	E	K	Y	D	A	V	D	M	Q	D	M	N	N	P	L	S	H	Y
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.							.				.	.	.	.	.	.																												.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.							.				.	.	.	.	.	.																												.
Template Sequence		T	K	E	H	L	T	K	F	I	N	Q	K	Q	R	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	I	D	K	Y	.	E	P	S	.	.	.	.	.	.	G	Q	L	S	P	E	G	M	V	W	F	L	C	G	P	E	N	S	V	L	A	Q	D	K	L	L	L	.	H	H	D	M	T	Q	P	L	N	H	Y
Template Known Secondary structure		B											T	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.							.				.	.	.	.	.	.		B												S	T	T	S		S	B		G	G	G	G	S	S	.		S				S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.							.				.	.	.	.	.	.																												.
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.										.	.	.	.	.	.		.	260	.							.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.			.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.
Query SS confidence																																												.	.
Query Sequence		W	I	S	S	S	H	N	T	Y	L	T	G	D	Q	L	R	S	E	S	S	P	E	A	Y	I	R	C	L	R	M	G	C	R	C	I	E	L	D	C	W	D	G	.	.	P	D	G	K	P	V	I	Y	H	G	W	T	R	T	T	K	I	K	F	D	D	V	V	Q	A	I	K	D	H	A	F	V	T	S	S	F
Query Conservation																																												.	.
Alig confidence																																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	I	N	S	S	H	N	T	Y	L	T	A	G	Q	F	S	G	L	S	S	A	E	M	Y	R	Q	V	L	L	S	G	C	R	C	V	E	L	D	C	W	K	G	K	P	P	D	E	E	P	I	I	T	H	G	F	T	M	T	T	D	I	F	F	K	E	A	I	E	A	I	A	E	S	A	F	K	T	S	P	Y
Template Known Secondary structure					B	B	S	S	T	T	B	S	S		S	S	S	S		B		T									T	T													T	T	T	T							T	T	S	S																	T	T	T	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.					.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.																												.	.	.	.
Query SS confidence												.																												.	.	.	.
Query Sequence		P	V	I	L	S	I	E	E	H	C	.	S	V	E	Q	Q	R	H	M	A	K	A	F	K	E	V	F	G	D	L	L	L	T	K	P	T	E	A	.	.	.	.	S	A	D	Q	L	P	S	P	S	Q	L	R	E	K	I	I	I	K	H	K	K	L	G	P	R	G	D	V	D	V	N	M	E	D	K	K	D	E
Query Conservation												.																												.	.	.	.
Alig confidence												.																												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	I	I	L	S	F	E	N	H	V	D	S	P	R	Q	Q	A	K	M	A	E	Y	C	R	T	I	F	G	D	M	L	L	T	E	P	L	E	K	F	P	L	K	P	G	V	P	L	P	S	P	E	D	L	R	G	K	I	L	I	K	N	K	K	E	E	S	G	N	L	D	E	E	E	I	K	K	M	Q	S	D
Template Known Secondary structure																													G	G	G	B			S			T	T	S		S	S	T	T						T	T	T	T	T	T																T	T	T	T	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	K	Q	Q	G	E	L	Y	M	W	D	S	I	D	Q	K	W	T	R	H	Y	C	A	I	A	D	A	K	L	S	F	S	D	D	I	E	Q	T	M	E	E	E	V	P	Q	D	I	P	P	T	E	L	H	F	G	E	K	W	F	H	K	K	V	E	K	R	T	S	A	E	K	L	L	Q	E	Y	C	M	E	T
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		529	530
		555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	K	D	G	T	F	L	V	R	E	S	E	T	F	P	N	D	Y	T	L	S	F	W	R	S	G	R	V	Q	H	C	R	I	R	S	T	M	E	G	G	T	L	K	Y	Y	L	T	D	N	L	T	F	S	S	I	Y	A	L	I	Q	H	Y	R	E	T	H	L	R	C	A	E	F	E	L	R	L	T	D	P
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		635	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	N	P	N	P	H	E	S	K	P	W	Y	Y	D	S	L	S	R	G	E	A	E	D	M	L	M	R	I	P	R	D	G	A	F	L	I	R	K	R	E	G	S	D	S	Y	A	I	T	F	R	A	R	G	K	V	K	H	C	R	I	N	R	D	G	R	H	F	V	L	G	T	S	A	Y	F	E	S	L	V
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		715	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	V	S	Y	Y	E	K	H	S	L	Y	R	K	M	R	L	R	Y	P	V	T	P	E	L	L	E	R	Y	N	M	E	R	D	I	N	S	L	Y	D	V	S	R	M	Y	V	D	P	S	E	I	N	P	S	M	P	Q	R	T	V	K	A	L	Y	D	Y	K	A	K	R	S	D	E	L	S	F	C	R	G	A
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		795	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	H	N	V	S	K	E	P	G	G	W	W	K	G	D	Y	G	T	R	I	Q	Q	Y	F	P	S	N	Y	V	E	D	I	S	T	A	D	F	E	E	L	E	K	Q	I	I	E	D	N	P	L	G	S	L	C	R	G	I	L	D	L	N	T	Y	N	V	V	K	A	P	Q	G	K	N	Q	K	S	F	V	F
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		875	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.			.	.	.	950	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.
Query SS confidence																																																																										.	.
Query Sequence		I	L	E	P	K	Q	Q	G	D	P	P	V	E	F	A	T	D	R	V	E	E	L	F	E	W	F	Q	S	I	R	E	I	T	W	K	I	D	T	K	E	N	N	M	K	Y	W	E	K	N	Q	S	I	A	I	E	L	S	D	L	V	V	Y	C	K	P	T	S	K	T	K	D	N	.	.	L	E	N	P	D	F
Query Conservation																																																																										.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	G	L	E	V	T	A	Y	E	E	M	S	S	L	V	N	Y	I	Q	P	T	K	F	V	S	F	E	F	S	A	Q	K	N	R	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G											T	T		S	S																T		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																														531	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
		953	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	I	R	S	F	V	E	T	K	A	D	S	I	I	R	Q	K	P	V	D	L	L	K	Y	N	Q	K	G	L	T	R	V	Y	P	K	G	Q	R	V	D	S	S	N	Y	D	P	F	R	L	W	L	C	G	S	Q	M	V	A	L	N	F	Q	T	A	D	K	Y	M	Q	M	N	H	A	L	F	S	L	N	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	V	I	S	S	F	T	E	L	K	A	Y	D	L	L	S	K	A	S	V	Q	F	V	D	Y	N	K	R	Q	M	S	R	I	Y	P	K	G	T	R	M	D	S	S	N	Y	M	P	Q	M	F	W	N	A	G	C	Q	M	V	A	L	N	F	Q	T	M	D	L	P	M	Q	Q	N	M	A	V	F	E	F	N	G
Template Known Secondary structure		T																												S								T	T		T	T												T	T						B		T	T			S										T	T	T	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
		1033	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.			1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110
Predicted Secondary structure																																																																					.	.
Query SS confidence																																																																					.	.
Query Sequence		R	T	G	Y	V	L	Q	P	E	S	M	R	T	E	K	Y	D	P	M	P	P	E	S	Q	R	K	I	L	M	T	L	T	V	K	V	L	G	A	R	H	L	P	K	L	G	R	S	I	A	C	P	F	V	E	V	E	I	C	G	A	E	Y	D	N	N	K	F	.	.	K	T	T	V	V	N	D	N	G	L	S
Query Conservation																																																																					.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.																				.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Sequence		Q	S	G	Y	L	L	K	H	E	F	M	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	T	L	S	I	T	V	I	S	G	Q	F	L	S	E	R	S	.	.	.	V	R	T	Y	V	E	V	E	L	F	G	L	P	G	D	P	K	R	R	Y	R	T	K	L	S	P	S	T	N	S	I	N
Template Known Secondary structure		G		S						G	G	G	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S			S	S		.	.	.													T	T	S											S	S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template SS confidence
		647	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.															660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.				.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		1111	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.		.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.
Query SS confidence															.
Query Sequence		P	I	W	A	P	T	Q	E	K	V	T	F	E	.	I	Y	D	P	N	L	A	F	L	R	F	V	V	Y	E	E	D	M	F	S	D	P	N	F	L	A	H	A	T	Y	P	I	K	A	V	K	S	G	F	R	S	V	P	L	K	N	G	Y	S	E	D	I	E	L	A	S	L	L	V	F	C	E	M	R	P
Query Conservation															.
Alig confidence						.	.								.																		.	.	.	.
Template Conservation						.	.																										.	.	.	.
Template Sequence		P	V	W	K	.	.	E	E	P	F	V	F	E	K	I	L	M	P	E	L	A	S	L	R	V	A	V	M	E	E	G	.	.	.	.	N	K	F	L	G	H	R	I	I	P	I	N	A	L	N	S	G	Y	H	H	L	C	L	H	S	E	S	N	M	P	L	T	M	P	A	L	F	I	F	L	E	M	K	D
Template Known Secondary structure			B			.	.										S		G	G	G										T	T	.	.	.	.	T										G	G	G	B												T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.																										.	.	.	.
Template SS confidence
		727	.	.	730			.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.					.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.