Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q13601 Date Wed May 9 17:52:34 BST 2012 Unique Job ID 6ba67881044192c4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	S	P	S	L	E	R	P	E	K	G	A	G	K	S	E	F	R	N	Q	K	P	K	P	E	N	Q	D	E	S	E	L	L	T	V	P	D	G	W	K	E	P	A	F	S	K	E	D	N	P	R	G	L	L	E	E	S	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	T	L	F	P	K	Y	R	E	A	Y	L	K	E	C	W	P	L	V	Q	K	A	L	N	E	H	H	V	N	A	T	L	D	L	I	E	G	S	M	T	V	C	T	T	K	K	T	F	D	P	Y	I	I	I	R	A	R	D	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	L	L	A	R	S	V	S	F	E	Q	A	V	R	I	L	Q	D	D	V	A	C	D	I	I	K	I	G	S	L	V	R	N	K	E	R	F	V	K	R	R	Q	R	L	I	G	P	K	G	S	T	L	K	A	L	E	L	L	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?				?	?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		C	Y	I	M	V	Q	G	N	T	V	S	A	I	G	P	F	S	G	L	K	E	V	R	K	V	V	L	D	T	M	K	N	I	H	P	I	Y	N	I	K	S	L	M	I	K	R	E	L	A	K	D	S	E	L	R	S	Q	S	W	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?														?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	F	L	P	Q	F	K	H	K	N	V	N	K	R	K	E	P	K	K	K	T	V	K	K	E	Y	T	P	F	P	P	P	Q	P	E	S	Q	I	D	K	E	L	A	S	G	E	Y	F	L	K	A	N	Q	K	K	R	Q	K	M	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	I	K	A	K	Q	A	E	A	I	S	K	R	Q	E	E	R	N	K	A	F	I	P	P	K	E	K	P	I	V	K	P	K	E	A	S	T	E	T	K	I	D	V	A	S	I	K	E	K	V	K	K	A	K	N	K	K	L	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Sequence		L	T	A	E	E	I	A	L	K	M	E	A	D	E	K	K	K	K	K	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?							?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand