Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description O15350 Date Thu Apr 26 09:24:59 BST 2012 Unique Job ID 685bf8351938467f

Secondary structure and disorder prediction

1

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10

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20

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30

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40

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50

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60

Sequence

M

A

Q

S

T

A

T

S

P

D

G

G

T

T

F

E

H

L

W

S

S

L

E

P

D

S

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Y

F

D

L

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Q

S

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G

N

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E

V

V

G

G

T

D

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S

M

D

V

F

H

L

E

G

M

T

T

S

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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70

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80

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90

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100

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110

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120

Sequence

V

M

A

Q

F

N

L

L

S

S

T

M

D

Q

M

S

S

R

A

A

S

A

S

P

Y

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E

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A

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V

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M

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V

I

P

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N

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D

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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130

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140

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150

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160

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170

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180

Sequence

Y

P

G

P

H

H

F

E

V

T

F

Q

Q

S

S

T

A

K

S

A

T

W

T

Y

S

P

L

L

K

K

L

Y

C

Q

I

A

K

T

C

P

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Q

I

K

V

S

T

P

P

P

P

G

T

A

I

R

A

M

P

V

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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190

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200

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210

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220

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230

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240

Sequence

Y

K

K

A

E

H

V

T

D

V

V

K

R

C

P

N

H

E

L

G

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S

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V

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S

V

V

V

P

Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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250

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260

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270

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280

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290

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300

Sequence

E

P

P

Q

V

G

T

E

F

T

T

I

L

Y

N

F

M

C

N

S

S

C

V

G

G

M

N

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P

I

L

I

I

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L

E

M

R

D

G

Q

V

L

G

R

R

S

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E

G

R

I

C

A

C

P

G

R

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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Disorder confidence

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310

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320

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330

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340

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350

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360

Sequence

D

R

K

A

D

E

D

H

Y

R

E

Q

Q

A

L

N

E

S

S

A

K

N

G

A

A

S

K

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K

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P

P

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V

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G

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G

V

K

K

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H

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Y

Y

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V

R

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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370

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380

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390

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400

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410

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420

Sequence

G

R

E

N

F

E

I

L

M

K

L

K

E

S

L

E

L

M

E

L

V

P

Q

P

L

V

D

S

Y

R

Q

Q

Q

Q

L

L

Q

R

P

S

H

L

Q

P

P

S

Y

G

P

V

L

S

P

M

N

K

V

H

G

G

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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430

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440

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450

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460

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470

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480

Sequence

M

N

K

L

P

S

V

N

Q

L

V

G

Q

P

P

P

H

S

S

A

A

T

P

N

L

G

P

V

G

P

G

M

L

N

N

H

G

H

A

V

P

A

N

G

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M

S

S

S

H

S

A

Q

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M

V

S

G

S

H

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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490

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500

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510

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520

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530

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540

Sequence

C

T

P

P

P

P

Y

H

A

D

P

S

L

V

S

F

L

T

G

L

G

C

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N

C

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F

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S

Q

G

L

Q

S

I

Y

H

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Q

N

L

T

I

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A

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K

I

P

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Y

R

M

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Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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550

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560

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570

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580

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590

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600

Sequence

I

W

R

G

L

Q

D

L

K

Q

G

H

D

Y

S

T

A

Q

Q

L

L

R

S

S

N

A

A

T

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S

I

G

G

S

G

E

L

Q

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Q

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V

M

E

A

V

H

F

R

V

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H

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I

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P

N

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G

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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620

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630

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Sequence

G

P

G

G

G

P

D

E

W

A

D

F

G

F

D

L

P

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C

K

A

R

K

Q

P

I

K

E

E

F

T

E

A

E

I

H

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand