Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0FGR8 Date Sat Jun 16 10:27:15 BST 2012 Unique Job ID 62d23792cd3259e4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	A	N	R	D	A	A	L	S	S	H	R	H	P	G	C	A	Q	R	P	R	T	P	T	F	A	S	S	S	Q	R	R	S	A	F	G	F	D	D	G	N	F	P	G	L	G	E	R	S	H	A	P	G	S	R	L	G	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	R	A	K	T	A	R	G	L	R	G	H	R	Q	R	G	A	G	A	G	L	S	R	P	G	S	A	R	A	P	S	P	P	R	P	G	G	P	E	N	P	G	G	V	L	S	V	E	L	P	G	L	L	A	Q	L	A	R	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	L	L	L	P	V	Y	A	L	G	Y	L	G	L	S	F	S	W	V	L	L	A	L	A	L	L	A	W	C	R	R	S	R	G	L	K	A	L	R	L	C	R	A	L	A	L	L	E	D	E	E	R	V	V	R	L	G	V	R	A
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Disorder																																?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		C	D	L	P	A	W	V	H	F	P	D	T	E	R	A	E	W	L	N	K	T	V	K	H	M	W	P	F	I	C	Q	F	I	E	K	L	F	R	E	T	I	E	P	A	V	R	G	A	N	T	H	L	S	T	F	S	F	T	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?																																											?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	V	G	Q	Q	P	L	R	I	N	G	V	K	V	Y	T	E	N	V	D	K	R	Q	I	I	L	D	L	Q	I	S	F	V	G	N	C	E	I	D	L	E	I	K	R	Y	F	C	R	A	G	V	K	S	I	Q	I	H	G	T	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?																							?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	V	I	L	E	P	L	I	G	D	M	P	L	V	G	A	L	S	I	F	F	L	R	K	P	L	L	E	I	N	W	T	G	L	T	N	L	L	D	V	P	G	L	N	G	L	S	D	T	I	I	L	D	I	I	S	N	Y	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?																									?	?	?																				?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	P	N	R	I	T	V	P	L	V	S	E	V	Q	I	A	Q	L	R	F	P	V	P	K	G	V	L	R	I	H	F	I	E	A	Q	D	L	Q	G	K	D	T	Y	L	K	G	L	V	K	G	K	S	D	P	Y	G	I	I	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	N	Q	I	F	Q	S	R	V	I	K	E	N	L	S	P	K	W	N	E	V	Y	E	A	L	V	Y	E	H	P	G	Q	E	L	E	I	E	L	F	D	E	D	P	D	K	D	D	F	L	G	S	L	M	I	D	L	I	E	V	E
Secondary structure
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Disorder				?																																																								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		K	E	R	L	L	D	E	W	F	T	L	D	E	V	P	K	G	K	L	H	L	R	L	E	W	L	T	L	M	P	N	A	S	N	L	D	K	V	L	T	D	I	K	A	D	K	D	Q	A	N	D	G	L	S	S	A	L	L	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?	?									?	?	?	?										?	?	?	?		?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Y	L	D	S	A	R	N	L	P	S	G	K	K	I	S	S	N	P	N	P	V	V	Q	M	S	V	G	H	K	A	Q	E	S	K	I	R	Y	K	T	N	E	P	V	W	E	E	N	F	T	F	F	I	H	N	P	K	R	Q	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		E	V	E	V	R	D	E	Q	H	Q	C	S	L	G	N	L	K	V	P	L	S	Q	L	L	T	S	E	D	M	T	V	S	Q	R	F	Q	L	S	N	S	G	P	N	S	T	I	K	M	K	I	A	L	R	V	L	H	L	E	K	R
Secondary structure
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Disorder																										?	?	?	?			?							?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		E	R	P	P	D	H	Q	H	S	A	Q	V	K	R	P	S	V	S	K	E	G	R	K	T	S	I	K	S	H	M	S	G	S	P	G	P	G	G	S	N	T	A	P	S	T	P	V	I	G	G	S	D	K	P	G	M	E	E	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?		?	?	?		?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		Q	P	P	E	A	G	P	Q	G	L	H	D	L	G	R	S	S	S	S	L	L	A	S	P	G	H	I	S	V	K	E	P	T	P	S	I	A	S	D	I	S	L	P	I	A	T	Q	E	L	R	Q	R	L	R	Q	L	E	N	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		T	L	G	Q	S	P	L	G	Q	I	Q	L	T	I	R	H	S	S	Q	R	N	K	L	I	V	V	V	H	A	C	R	N	L	I	A	F	S	E	D	G	S	D	P	Y	V	R	M	Y	L	L	P	D	K	R	R	S	G	R	R	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		T	H	V	S	K	K	T	L	N	P	V	F	D	Q	S	F	D	F	S	V	S	L	P	E	V	Q	R	R	T	L	D	V	A	V	K	N	S	G	G	F	L	S	K	D	K	G	L	L	G	K	V	L	V	A	L	A	S	E	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?		?	?	?															?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.
Sequence		A	K	G	W	T	Q	W	Y	D	L	T	E	D	G	T	R	P	Q	A	M	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?						?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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