Phyre 2 Results for P42684

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	P42684
Date	Thu Apr 26 09:29:57 BST 2012
Unique Job ID	619a27941010e026

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M G Q Q V G R V G E A P G L Q Q P Q P R G I R G S S A A R P S G R R R D P A G R T T E T G F N I F T Q H D H F A S C V E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence D G F E G D K T G G S S P E A L H R P Y G C D V E P Q A L N E A I R W S S K E N L L G A T E S D P N L F V A L Y D F V A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence S G D N T L S I T K G E K L R V L G Y N Q N G E W S E V R S K N G Q G W V P S N Y I T P V N S L E K H S W Y H G P V S R

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ?
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence S A A E Y L L S S L I N G S F L V R E S E S S P G Q L S I S L R Y E G R V Y H Y R I N T T A D G K V Y V T A E S R F S T

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence L A E L V H H H S T V A D G L V T T L H Y P A P K C N K P T V Y G V S P I H D K W E M E R T D I T M K H K L G G G Q Y G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?
?
? ? ?
?
? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence E V Y V G V W K K Y S L T V A V K T L K E D T M E V E E F L K E A A V M K E I K H P N L V Q L L G V C T L E P P F Y I V

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence T E Y M P Y G N L L D Y L R E C N R E E V T A V V L L Y M A T Q I S S A M E Y L E K K N F I H R D L A A R N C L V G E N

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence H V V K V A D F G L S R L M T G D T Y T A H A G A K F P I K W T A P E S L A Y N T F S I K S D V W A F G V L L W E I A T

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence Y G M S P Y P G I D L S Q V Y D L L E K G Y R M E Q P E G C P P K V Y E L M R A C W K W S P A D R P S F A E T H Q A F E

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence T M F H D S S I S E E V A E E L G R A A S S S S V V P Y L P R L P I L P S K T R T L K K Q V E N K E N I E G A Q D A T E

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence N S A S S L A P G F I R G A Q A S S G S P A L P R K Q R D K S P S S L L E D A K E T C F T R D R K G G F F S S F M K K R

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence N A P T P P K R S S S F R E M E N Q P H K K Y E L T G N F S S V A S L Q H A D G F S F T P A Q Q E A N L V P P K C Y G G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence S F A Q R N L C N D D G G G G G G S G T A G G G W S G I T G F F T P R L I K K T L G L R A G K P T A S D D T S K P F P R

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence S N S T S S M S S G L P E Q D R M A M T L P R N C Q R S K L Q L E R T V S T S S Q P E E N V D R A N D M L P K K S E E S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence A A P S R E R P K A K L L P R G A T A L P L R T P S G D L A I T E K D P P G V G V A G V A A A P K G K E K N G G A R L G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence M A G V P E D G E Q P G W P S P A K A A P V L P T T H N H K V P V L I S P T L K H T P A D V Q L I G T D S Q G N K F K L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence L S E H Q V T S S G D K D R P R R V K P K C A P P P P P V M R L L Q H P S I C S D P T E E P T A L T A G Q S T S E T Q E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence G G K K A A L G A V P I S G K A G R P V M P P P Q V P L P T S S I S P A K M A N G T A G T K V A L R K T K Q A A E K I S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence A D K I S K E A L L E C A D L L S S A L T E P V P N S Q L V D T G H Q L L D Y C S G Y V D C I P Q T R N K F A F R E A V

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ?
? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . .

Sequence S K L E L S L Q E L Q V S S A A A G V P G T N P V L N N L L S C V Q E I S D V V Q R

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand