Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0AVI4 Date Fri May 25 09:55:06 BST 2012 Unique Job ID 5cf7a897e3c457ee

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	S	P	E	V	T	F	T	L	A	Y	L	V	F	A	V	C	F	V	F	T	P	N	E	F	H	A	A	G	L	T	V	Q	N	L	L	S	G	W	L	G	S	E	D	A	A	F	V	P	F	H	L	R	R	T	A	A	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	C	H	S	L	L	P	L	G	Y	Y	V	G	M	C	L	A	A	S	E	K	R	L	H	A	L	S	Q	A	P	E	A	W	R	L	F	L	L	L	A	V	T	L	P	S	I	A	C	I	L	I	Y	Y	W	S	R	D	R	W	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		C	H	P	L	A	R	T	L	A	L	Y	A	L	P	Q	S	G	W	Q	A	V	A	S	S	V	N	T	E	F	R	R	I	D	K	F	A	T	G	A	P	G	A	R	V	I	V	T	D	T	W	V	M	K	V	T	T	Y	R	V	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?				?		?																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	A	Q	Q	Q	D	V	H	L	T	V	T	E	S	R	Q	H	E	L	S	P	D	S	N	L	P	V	Q	L	L	T	I	R	V	A	S	T	N	P	A	V	Q	A	F	D	I	W	L	N	S	T	E	Y	G	E	L	C	E	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	A	P	I	R	R	A	A	H	V	V	I	H	Q	S	L	G	D	L	F	L	E	T	F	A	S	L	V	E	V	N	P	A	Y	S	V	P	S	S	Q	E	L	E	A	C	I	G	C	M	Q	T	R	A	S	V	K	L	V	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?					?	?	?																						?	?			?	?	?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		C	Q	E	A	A	T	G	E	C	Q	Q	C	Y	C	R	P	M	W	C	L	T	C	M	G	K	W	F	A	S	R	Q	D	P	L	R	P	D	T	W	L	A	S	R	V	P	C	P	T	C	R	A	R	F	C	I	L	D	V	C	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?		?																				?	?	?		?	?	?																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.
Sequence		V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand