Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A1A4S6 Date Wed May 9 18:01:49 BST 2012 Unique Job ID 5443ad005cccc0f3

Secondary structure and disorder prediction

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Sequence		M	G	L	Q	P	L	E	F	S	D	C	Y	L	D	S	P	W	F	R	E	R	I	R	A	H	E	A	E	L	E	R	T	N	K	F	I	K	E	L	I	K	D	G	K	N	L	I	A	A	T	K	S	L	S	V	A	Q	R	K	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	H	S	L	R	D	F	K	F	E	F	I	G	D	A	V	T	D	D	E	R	C	I	D	A	S	L	R	E	F	S	N	F	L	K	N	L	E	E	Q	R	E	I	M	A	L	S	V	T	E	T	L	I	K	P	L	E	K	F	R
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Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	E	Q	L	G	A	V	K	E	E	K	K	K	F	D	K	E	T	E	K	N	Y	S	L	I	D	K	H	L	N	L	S	A	K	K	K	D	S	H	L	Q	E	A	D	I	Q	V	E	Q	N	R	Q	H	F	Y	E	L	S	L	E
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Disorder											?																					?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	V	C	K	L	Q	E	I	Q	E	R	K	K	F	E	F	V	E	P	M	L	S	F	F	Q	G	M	F	T	F	Y	H	Q	G	H	E	L	A	K	D	F	N	H	Y	K	M	E	L	Q	I	N	I	Q	N	T	R	N	R	F	E
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	T	R	S	E	V	E	E	L	M	N	K	I	R	Q	N	P	K	D	H	K	R	A	S	Q	F	T	A	E	G	Y	L	Y	V	Q	E	K	R	P	A	P	F	G	S	S	W	V	K	H	Y	C	M	Y	R	K	A	A	K	K	F
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Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?
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Sequence		N	M	I	P	F	E	H	R	S	G	G	K	L	G	D	G	E	V	F	F	L	K	E	C	T	K	R	H	T	D	S	I	D	R	R	F	C	F	D	I	E	A	A	D	R	P	G	V	S	L	T	M	Q	A	F	S	E	E	E	R
Secondary structure
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Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		K	Q	W	L	E	A	L	G	G	K	E	A	L	S	H	S	F	N	T	A	I	I	P	R	P	E	G	N	A	Q	L	D	K	M	G	F	T	I	I	R	K	C	I	S	A	V	E	T	R	G	I	N	D	Q	G	L	Y	R	V	V
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Disorder											?	?		?	?														?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	V	S	S	K	V	Q	R	L	L	S	M	L	M	D	V	K	T	C	N	E	V	D	L	E	N	S	A	D	W	E	V	K	T	I	T	S	A	L	K	Q	Y	L	R	S	L	P	E	P	L	M	T	Y	E	L	H	G	D	F	I
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	P	A	K	S	G	S	P	E	S	R	V	N	A	I	H	F	L	V	H	K	L	P	E	K	N	K	E	M	L	D	I	L	V	K	H	L	T	N	V	S	N	H	S	K	Q	N	L	M	T	V	A	N	L	G	V	V	F	G	P
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	L	M	R	P	Q	E	E	T	V	A	A	L	M	D	L	K	F	Q	N	I	V	V	E	I	L	I	E	N	H	E	K	I	F	R	T	P	P	D	T	T	F	P	E	P	T	C	L	S	A	S	P	P	N	A	P	P	R	Q	S
Secondary structure
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Disorder						?	?	?	?	?							?																								?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		K	R	Q	G	Q	R	T	K	R	P	V	A	V	Y	N	L	C	L	E	L	E	D	G	D	N	P	Y	P	S	K	E	D	T	P	T	S	S	L	D	S	L	S	S	P	S	P	V	T	T	A	V	P	G	P	P	G	P	D	K	N
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		H	L	L	A	D	G	G	S	F	G	D	W	A	S	T	I	P	G	Q	T	R	S	S	M	V	Q	W	L	N	P	Q	S	P	T	T	T	S	S	N	S	A	V	T	P	L	S	P	G	S	S	P	F	P	F	S	P	P	A	T	V
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		A	D	K	P	P	E	S	I	R	S	R	K	A	R	A	V	Y	P	C	E	A	E	H	S	S	E	L	S	F	E	I	G	A	I	F	E	D	V	Q	T	S	R	E	P	G	W	L	E	G	T	L	N	G	K	R	G	L	I	P	Q
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.
Sequence		N	Y	V	K	L	L
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Disorder		?				?	?
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