Phyre 2 Results for A0JNW5

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	A0JNW5
Date	Fri May 25 09:57:59 BST 2012
Unique Job ID	542c8aca34e6f95b

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M A G I I K K Q I L K H L S R F T K N L S P D K I N L S T L K G E G E L K N L E L D E E V L Q N M L D L P T W L A I N K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence V F C N K A S I R I P W T K L K T H P I C L S L D K V I M E M S T C E E P R S P N G P S P I A T A S G Q S E Y G F A E K

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence V V E G I S V S V N S I V I R I G A K A F N A S F E L S Q L R I Y S V N A H W E H G D L R F T R I Q D P Q R G E V L T F

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence K E I N W Q M I R I E A D A T Q S S H L E I M C A P V R L I T N Q S K I R V T L K R R L K D C N V I A T K L V L I L D D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence L L W V L T D S Q L K A M V Q Y A K S L S E A I E K S T E Q R K S M A P E P T Q S S T V V A S A Q Q V K T T Q T S N A P

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence D V N D A I V K L F N D F D V K E T S H H L V I S H L D L H I C D D I H A K E K E S N R R I T G G A M Q L S F T Q L T I

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence D Y Y P Y H K A G D S C N H W M Y F S D A T K T K N G W A N E L L H E F E C N V E M L K Q A V K D H N V G S P P K S P T

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence H A S P Q H T Q T E K D Y P L K G T C R T P S V L S Q Q S K A K L M S S S V V V R L A D F N I Y Q V S T A E Q C R S S P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence K S M I C C N K K S L Y L P Q E M S A V Y I E F T E Y Y Y P D G K D F P I P S P N L Y S Q L N A L Q F T V D E R S I L W

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence L N Q F L L D L K Q S L N Q F M A V Y K L N D N S K S D E H V D V R V D G L M L K F V I P S E V K S E C H Q D Q P R A I

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence S I Q S S E M I A T N T R H C P N C R H S D L E A L F Q D F K D C D F F S K T Y T S F P K S C D N F N L L H P I F Q R H

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ?
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence A H E Q D T K M H E I Y K G N I T P Q L N K N T L K T S A A T D V W A V Y F S Q F W I D Y E G M K S G K G R P I S F V D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ?
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence S F P L S I W I C Q P T R Y A E S Q K E P Q T C N Q V S L N T S Q S E S S D L A G R L K R K K L L K E Y Y S T E S E P L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence T N G G Q K P S S S D T F F R F S P S S S E A D I H L L V H V H K H V S M Q I N H Y Q Y L L L L F L H E S L I L L S E N

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence L R K D V E A V T G S P A S Q T S I C I G I L L R S A E L A L L L H P V D Q A N T L K S P V S E S V S P V V P D Y L P T

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence E N G D F L S S K R K Q I S R D I N R I R S V T V N H M S D N R S M S V D L S H I P L K D P L L F K S A S D T N L Q K G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence I S F M D Y L S D K H L G K I S E D E S S G L V Y K S G S G E I G S E T S D K K D S F Y T D S S S I L N Y R E D S N I L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence S F D S D G N Q N I L S S T L T S K G N E T I E S I F K A E D L L P E A A S L S E N L D I S K E E T P P V R T L K S Q S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence S L S G K P K E R C P P N L A P L C V S Y K N M K R S S S Q M S L D T I S L D S M I L E E Q L L E S D G S D S H M F L E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . . . . . . . . . 1190 . . . . . . . . . 1200

Sequence K G N K K N S T T N Y R G T A E S V N A G A N L Q N Y G E T S P D A I S T N S E G A Q E N H D D L M S V V V F K I T G V

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1210 . . . . . . . . . 1220 . . . . . . . . . 1230 . . . . . . . . . 1240 . . . . . . . . . 1250 . . . . . . . . . 1260

Sequence N G E I D I R G E D T E I C L Q V N Q V T P D Q L G N I S L R H Y L C N R P V G S D Q K A V I H S K S S P E I S L R F E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ?
?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1270 . . . . . . . . . 1280 . . . . . . . . . 1290 . . . . . . . . . 1300 . . . . . . . . . 1310 . . . . . . . . . 1320

Sequence S G P G A V I H S L L A E K N G F L Q C H I E N F S T E F L T S S L M N I Q H F L E D E T V A T V M P M K I Q V S N T K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ?
?
?
?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1330 . . . . . . . . . 1340 . . . . . . . . . 1350 . . . . . . . . . 1360 . . . . . . . . . 1370 . . . . . . . . . 1380

Sequence I N L K D D S P R S S T V S L E P A P V T V H I D H L V V E R S D D G S F H I R D S H M L N T G N D L K E N V K S D S V

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1390 . . . . . . . . . 1400 . . . . . . . . . 1410 . . . . . . . . . 1420 . . . . . . . . . 1430 . . . . . . . . . 1440

Sequence L L T S G K Y D L K K Q R S V T Q A T Q T S P G V P W P S Q S A N F P E F S F D F T R E Q L M E E N E S L K Q E L A K A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1450 . . . . . . . . . 1460 . . . .

Sequence K M A L A E A H L E K D A L L H H I K K M T V E

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand