Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0AV96 Date Fri May 25 09:48:37 BST 2012 Unique Job ID 508d712d64f673b7

Secondary structure and disorder prediction

1

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10

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20

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30

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40

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50

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60

Sequence

M

T

A

E

D

S

T

A

A

M

S

S

D

S

A

A

G

S

S

A

K

V

P

E

G

V

A

G

A

P

N

E

A

A

L

L

A

L

M

E

R

T

G

Y

S

M

V

Q

E

N

G

Q

R

K

Y

G

G

P

P

P

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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70

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80

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90

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100

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110

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120

Sequence

G

W

E

G

P

H

P

Q

R

G

C

E

V

F

V

G

K

I

P

R

D

V

Y

E

D

E

L

V

P

V

F

E

A

V

G

R

I

Y

E

L

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L

M

M

D

F

D

G

K

N

R

G

Y

A

F

V

M

Y

C

H

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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?

Disorder confidence

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130

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140

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150

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160

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170

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180

Sequence

K

H

E

A

K

R

A

V

R

E

L

N

N

Y

E

I

R

P

G

R

L

L

G

V

C

C

S

V

D

N

C

R

L

F

I

G

G

I

P

K

M

K

K

R

E

E

I

L

E

E

I

A

K

V

T

E

G

V

L

D

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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?

Disorder confidence

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190

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200

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210

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220

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230

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240

Sequence

V

I

V

Y

A

S

A

A

D

K

M

K

N

R

G

F

A

F

V

E

Y

E

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A

A

A

M

A

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K

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M

P

G

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I

Q

L

W

G

H

Q

I

A

V

D

W

A

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P

E

I

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V

D

E

D

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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250

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260

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270

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280

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290

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300

Sequence

V

M

E

T

V

K

I

L

Y

V

R

N

L

M

I

E

T

T

E

D

T

I

K

K

S

F

G

Q

F

N

P

G

C

V

E

R

V

K

K

I

R

D

Y

A

F

V

H

F

T

S

R

E

D

A

V

H

A

M

N

N

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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?

?

Disorder confidence

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310

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320

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330

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340

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350

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360

Sequence

L

N

G

T

E

L

E

G

S

C

L

E

V

T

L

A

K

P

V

D

K

E

Q

Y

S

R

Y

Q

K

A

A

R

G

G

G

A

A

E

A

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Q

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P

S

Y

V

Y

S

C

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P

Y

T

L

A

Y

Y

G

Y

P

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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370

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380

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390

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400

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410

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420

Sequence

Y

N

A

L

I

G

P

N

R

D

Y

F

V

K

A

G

S

I

R

G

R

G

R

G

A

A

G

N

R

A

P

G

P

R

G

S

Y

L

G

G

Y

S

A

G

R

G

I

Y

S

R

Y

H

E

G

K

G

K

Q

Q

E

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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430

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440

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450

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460

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470

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480

Sequence

K

G

Y

E

L

V

P

N

L

E

I

P

T

V

N

P

V

A

I

K

P

G

T

V

A

I

P

A

I

G

A

Q

Y

S

M

F

P

A

A

P

A

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K

M

I

E

D

G

K

I

H

T

V

E

H

M

I

S

P

I

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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Disorder confidence

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490

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500

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510

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520

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530

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540

Sequence

A

V

Q

P

D

P

A

S

A

A

A

A

A

A

A

A

A

A

A

A

A

A

V

I

P

T

V

S

T

P

P

P

F

Q

G

R

P

I

T

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V

Y

T

V

A

P

N

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Q

R

I

P

T

A

G

I

Y

G

A

S

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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550

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560

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570

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580

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590

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Sequence

Y

V

P

F

A

A

P

A

T

A

T

I

A

T

L

Q

K

N

A

A

A

A

A

A

M

Y

G

G

Y

A

G

Y

I

P

Q

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F

P

A

A

A

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P

I

P

D

V

Y

Q

T

Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand