Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0PJK1 Date Tue Apr 3 14:59:03 BST 2012 Unique Job ID 4119271ea0e6f686

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	A	N	S	T	S	D	L	H	T	P	G	T	Q	L	S	V	A	D	I	I	V	I	T	V	Y	F	A	L	N	V	A	V	G	I	W	S	S	C	R	A	S	R	N	T	V	N	G	Y	F	L	A	G	R	D	M	T	W	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?																											?	?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	I	G	A	S	L	F	A	S	S	E	G	S	G	L	F	I	G	L	A	G	S	G	A	A	G	G	L	A	V	A	G	F	E	W	N	A	T	Y	V	L	L	A	L	A	W	V	F	V	P	I	Y	I	S	S	E	I	V	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	E	Y	I	Q	K	R	Y	G	G	Q	R	I	R	M	Y	L	S	V	L	S	L	L	L	S	V	F	T	K	I	S	L	D	L	Y	A	G	A	L	F	V	H	I	C	L	G	W	N	F	Y	L	S	T	I	L	T	L	G	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	L	Y	T	I	A	G	G	L	A	A	V	I	Y	T	D	A	L	Q	T	L	I	M	V	V	G	A	V	I	L	T	I	K	A	F	D	Q	I	G	G	Y	G	Q	L	E	A	A	Y	A	Q	A	I	P	S	R	T	I	A	N	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	C	H	L	P	R	T	D	A	M	H	M	F	R	D	P	H	T	G	D	L	P	W	T	G	M	T	F	G	L	T	I	M	A	T	W	Y	W	C	T	D	Q	V	I	V	Q	R	S	L	S	A	R	D	L	N	H	A	K	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	I	L	A	S	Y	L	K	M	L	P	M	G	L	I	I	M	P	G	M	I	S	R	A	L	F	P	D	D	V	G	C	V	V	P	S	E	C	L	R	A	C	G	A	E	V	G	C	S	N	I	A	Y	P	K	L	V	M	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	P	I	G	L	R	G	L	M	I	A	V	M	L	A	A	L	M	S	S	L	T	S	I	F	N	S	S	S	T	L	F	T	M	D	I	W	R	R	L	R	P	R	S	G	E	R	E	L	L	L	V	G	R	L	V	I	V	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	G	V	S	V	A	W	I	P	V	L	Q	D	S	N	S	G	Q	L	F	I	Y	M	Q	S	V	T	S	S	L	A	P	P	V	T	A	V	F	V	L	G	V	F	W	R	R	A	N	E	Q	G	A	F	W	G	L	I	A	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	V	G	A	T	R	L	V	L	E	F	L	N	P	A	P	P	C	G	E	P	D	T	R	P	A	V	L	G	S	I	H	Y	L	H	F	A	V	A	L	F	A	L	S	G	A	V	V	V	A	G	S	L	L	T	P	P	P	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	Q	I	E	N	L	T	W	W	T	L	A	Q	D	V	P	L	G	T	K	A	G	D	G	Q	T	P	Q	K	H	A	F	W	A	R	V	C	G	F	N	A	I	L	L	M	C	V	N	I	F	F	Y	A	Y	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																									?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand