Job Description Q92569 Confidence 100.00% Date Fri May 25 09:38:24 BST 2012 Rank 7 Aligned Residues 197 % Identity 44% Template c3gqiB_ PDB info PDB header:transferase/transferase inhibitor Chain: B: PDB Molecule:phospholipase c-gamma-1; PDBTitle: crystal structure of activated receptor tyrosine kinase in complex2 with substrates Resolution 2.50 Å

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		62	.	.	.	.	.	.	.	70	.						.	.	.	.	.	.	.	.							80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.					120	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.
Query Sequence		D	A	E	W	Y	W	G	D	I	S	.	.	.	.	.	R	E	E	V	N	D	K	L	.	.	.	.	.	.	R	D	M	P	D	G	T	F	L	V	R	D	A	S	T	K	M	Q	G	D	Y	T	L	T	L	R	K	G	G	N	N	K	L	I	K	I	Y	H	R	D	.	.	.	.	G	K	Y	G	F	S	D
Query Conservation												.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.																	.																								.	.	.	.
Template Conservation																																															.
Template Sequence		S	E	K	W	F	H	G	K	L	G	A	G	R	D	G	R	H	I	A	E	R	L	L	T	E	Y	C	I	E	T	G	A	P	D	G	S	F	L	V	R	E	S	E	T	F	.	V	G	D	Y	T	L	S	F	W	R	N	G	K	V	Q	H	C	R	I	H	S	R	Q	D	A	G	T	P	K	F	F	L	T	D
Template Known Secondary structure			S	T	T						G	G	G	S	S																	T			T	T								S	S	S	.	T	T	S								S	S													S	S	S							T
Template Predicted Secondary structure																																															.
Template SS confidence
		547	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.		.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	T	F	N	S	V	V	E	L	I	N	H	Y	H	H	E	S	L	A	Q	Y	N	P	K	L	D	V	K	L	M	Y	P	V	S	R	Y	Q	Q	D	Q	L	V	K	E	D	N	I	D	A	V	G	K	K	L	Q	E	Y	H	S	Q	Y	Q	E	K	S	K	E	Y	D	R	L	Y	E	E	Y	T	R	T	S
Query Conservation
Alig confidence																							.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	L	V	F	D	S	L	Y	D	L	I	T	H	Y	Q	Q	V	P	L	R	C	.	.	N	E	F	E	M	R	L	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T				S	S											S					.	.	S	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		626	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.			.	.	.	650	.	.	.	.	.
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	E	I	Q	M	K	R	T	A	I	E	A	F	N	E	T	I	K	I	F	E	E	Q	C	H	T	Q	E	Q	H	S	K	E	Y	I	E	R	F	R	R	E	G	N	E	K	E	I	E	R	I	M	M	N	Y	D	K	L	K	S	R	L	G	E	I	H	D	S	K	M	R	L	E	Q	D	L	K	N	Q	A	L
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	N	R	E	I	D	K	K	M	N	S	I	K	P	D	L	I	Q	L	R	K	I	R	D	Q	H	L	V	W	L	N	H	K	G	V	R	Q	K	R	L	N	V	W	L	G	I	K	N	E	D	A	D	E	N	Y	F	I	N	E	E	D	E	N	L	P	H	Y	D	E	K	T	W	F	V	E	D	I	N	R	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	P	Q	T	N	A	H	E	S	K	E	W	Y	H	A	S	L	T	R	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B				S	S	G	G	G	G	S	S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																													656	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.		.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.
Query SS confidence												.
Query Sequence		Q	A	E	D	L	L	Y	G	K	P	.	D	G	A	F	L	I	R	E	S	S	K	K	G	C	Y	A	C	S	V	V	A	D	G	E	V	K	H	C	V	I	Y	S	T	A	R	G	Y	G	F	A	E	P	Y	N	L	Y	S	S	L	K	E	L	V	L	H	Y	Q	Q	T	S	L	V	Q	H	N	D	S	L	N
Query Conservation												.
Alig confidence												.																																								.	.																					.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.																					.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	E	H	M	L	M	R	V	P	R	D	G	A	F	L	V	R	K	R	N	E	P	N	S	Y	A	I	S	F	R	A	E	G	K	I	K	H	C	R	V	Q	Q	E	G	Q	T	V	M	L	.	.	G	N	S	E	F	D	S	L	V	D	L	I	S	Y	Y	E	K	H	P	L	.	.	.	.	.	Y	R	K
Template Known Secondary structure									T			S	S	S								S	S	S	S									T	T											T	T					.	.	T	T				S	S									T	T	S		S	.	.	.	.	.	B	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		677	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.			.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.						.	.	.
		446	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	R	L	A	Y	P	V	H	A	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		M	K	L	R	Y	P	I	N	E	E
Template Known Secondary structure		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		750	.	.	.	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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