Job Description Q13625 Confidence 96.72% Date Wed Jun 6 09:54:47 BST 2012
Rank 298 Aligned Residues 152
% Identity 11% Template c2efrB_
PDB info
PDB header: contractile proteinChain: B: PDB Molecule: general control protein gcn4 and tropomyosin 1 alpha chain;
PDBTitle: crystal structure of the c-terminal tropomyosin fragment with n- and2 c-terminal extensions of the leucine zipper at 1.8 angstroms3 resolution
Resolution 1.80 Å
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114 . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
R K E N G V N S P R M D L T L A E L Q E M A S R Q Q Q Q I E A Q Q Q L L A T K E Q R L K F L K Q Q D Q R Q Q Q Q V A E Q E K L K R L K E I A E N Q E A K L K K V
Query Conservation  
                                                                                                                                                     
Alig confidence  
. .
Template Conservation  
                                                                                                                . .                                  
Template Sequence  
M K Q L E D K V E E L L S K N Y H L E N E V A R L K K L L E R A E E R A E L S E G K S A E L E E E L K T V T N N L K S L E .
.
A Q A E K Y S Q K E D K Y E E E I
Template Known Secondary structure  
. .
Template Predicted Secondary structure  
. .
Template SS confidence  
   
148 . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . .
. 210 . . . . . . . . . 220 . . . . .
 
   
194 . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
R A L K G H V E Q K R L S N G K L V E E I E Q M N N L F Q Q K Q R E L V L A V S K V E E L T R Q L E M L K N G R I D S H H D N Q S A V A E L D R L Y
Query Conservation  
                                                                                                                                 
Alig confidence  
Template Conservation  
                                                                                                                                 
Template Sequence  
K V L S D K L K E A E T R A E F A E R S V T K L E K S I D D L E D E L Y A Q K L K Y K A I S E E M K Q L E D K V E E L L S K N Y H L E N E V A R L K
Template Known Secondary structure  
T
Template Predicted Secondary structure  
Template SS confidence  
   
226 . . . 230 . . . . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]