Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P43405 Date Fri May 25 09:37:32 BST 2012 Unique Job ID 2db15a2455b16f33

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	S	S	G	M	A	D	S	A	N	H	L	P	F	F	F	G	N	I	T	R	E	E	A	E	D	Y	L	V	Q	G	G	M	S	D	G	L	Y	L	L	R	Q	S	R	N	Y	L	G	G	F	A	L	S	V	A	H	G	R	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	H	H	Y	T	I	E	R	E	L	N	G	T	Y	A	I	A	G	G	R	T	H	A	S	P	A	D	L	C	H	Y	H	S	Q	E	S	D	G	L	V	C	L	L	K	K	P	F	N	R	P	Q	G	V	Q	P	K	T	G	P	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	D	L	K	E	N	L	I	R	E	Y	V	K	Q	T	W	N	L	Q	G	Q	A	L	E	Q	A	I	I	S	Q	K	P	Q	L	E	K	L	I	A	T	T	A	H	E	K	M	P	W	F	H	G	K	I	S	R	E	E	S	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?								?	?											?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	V	L	I	G	S	K	T	N	G	K	F	L	I	R	A	R	D	N	N	G	S	Y	A	L	C	L	L	H	E	G	K	V	L	H	Y	R	I	D	K	D	K	T	G	K	L	S	I	P	E	G	K	K	F	D	T	L	W	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?		?																																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	E	H	Y	S	Y	K	A	D	G	L	L	R	V	L	T	V	P	C	Q	K	I	G	T	Q	G	N	V	N	F	G	G	R	P	Q	L	P	G	S	H	P	A	T	W	S	A	G	G	I	I	S	R	I	K	S	Y	S	F	P	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?		?	?	?													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	G	H	R	K	S	S	P	A	Q	G	N	R	Q	E	S	T	V	S	F	N	P	Y	E	P	E	L	A	P	W	A	A	D	K	G	P	Q	R	E	A	L	P	M	D	T	E	V	Y	E	S	P	Y	A	D	P	E	E	I	R	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	E	V	Y	L	D	R	K	L	L	T	L	E	D	K	E	L	G	S	G	N	F	G	T	V	K	K	G	Y	Y	Q	M	K	K	V	V	K	T	V	A	V	K	I	L	K	N	E	A	N	D	P	A	L	K	D	E	L	L	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?																																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	N	V	M	Q	Q	L	D	N	P	Y	I	V	R	M	I	G	I	C	E	A	E	S	W	M	L	V	M	E	M	A	E	L	G	P	L	N	K	Y	L	Q	Q	N	R	H	V	K	D	K	N	I	I	E	L	V	H	Q	V	S	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		G	M	K	Y	L	E	E	S	N	F	V	H	R	D	L	A	A	R	N	V	L	L	V	T	Q	H	Y	A	K	I	S	D	F	G	L	S	K	A	L	R	A	D	E	N	Y	Y	K	A	Q	T	H	G	K	W	P	V	K	W	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	E	C	I	N	Y	Y	K	F	S	S	K	S	D	V	W	S	F	G	V	L	M	W	E	A	F	S	Y	G	Q	K	P	Y	R	G	M	K	G	S	E	V	T	A	M	L	E	K	G	E	R	M	G	C	P	A	G	C	P	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?		?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
Sequence		M	Y	D	L	M	N	L	C	W	T	Y	D	V	E	N	R	P	G	F	A	A	V	E	L	R	L	R	N	Y	Y	Y	D	V	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?				?	?																?		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand