Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0AV02 Date Wed Jun 6 09:26:36 BST 2012 Unique Job ID 2cf7aaf7c591a056

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	Q	M	S	Q	V	Q	E	L	F	H	E	A	A	Q	Q	D	A	L	A	Q	P	Q	P	W	W	K	T	Q	L	F	M	W	E	P	V	L	F	G	T	W	D	G	V	F	T	S	C	M	I	N	I	F	G	V	V	L	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	T	G	W	L	V	G	N	T	G	V	L	L	G	M	F	L	V	S	F	V	I	L	V	A	L	V	T	V	L	S	G	I	G	V	G	E	R	S	S	I	G	S	G	G	V	Y	S	M	I	S	S	V	L	G	G	Q	T	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	I	G	L	L	Y	V	F	G	Q	C	V	A	G	A	M	Y	I	T	G	F	A	E	S	I	S	D	L	L	G	L	G	N	I	W	A	V	R	G	I	S	V	A	V	L	L	A	L	L	G	I	N	L	A	G	V	K	W	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	L	Q	L	L	L	L	F	L	L	A	V	S	T	L	D	F	V	V	G	S	F	T	H	L	D	P	E	H	G	F	I	G	Y	S	P	E	L	L	Q	N	N	T	L	P	D	Y	S	P	G	E	S	F	F	T	V	F	G	V	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?							?		?			?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	P	A	A	T	G	V	M	A	G	F	N	M	G	G	D	L	R	E	P	A	A	S	I	P	P	G	S	L	A	A	V	G	I	S	W	F	L	Y	I	I	F	V	F	L	L	G	A	I	C	T	R	E	A	L	R	Y	D	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	A	E	K	V	S	L	M	G	F	L	F	L	L	G	L	Y	I	S	S	L	A	S	C	M	G	G	L	Y	G	A	P	R	I	L	Q	C	I	A	Q	E	K	V	I	P	A	L	A	C	L	G	Q	G	K	G	P	N	K	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	A	A	I	C	L	T	S	L	V	T	M	A	F	V	F	V	G	Q	V	N	V	L	A	P	I	V	T	I	N	F	M	L	T	Y	V	A	V	D	Y	S	Y	F	S	L	S	M	C	S	C	S	L	T	P	V	P	E	P	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																														?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	E	G	A	E	G	L	H	C	S	E	H	L	L	L	E	K	A	P	S	Y	G	S	E	G	P	A	Q	R	V	L	E	G	T	L	L	E	F	T	K	D	M	D	Q	L	L	Q	L	T	R	K	L	E	S	S	Q	P	R	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?			?	?						?	?	?	?	?	?	?	?		?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		E	G	N	R	T	P	E	S	Q	K	R	K	S	K	K	A	T	K	Q	T	L	Q	D	S	F	L	L	D	L	K	S	P	P	S	F	P	V	E	I	S	D	R	L	P	A	A	S	W	E	G	Q	E	S	C	W	N	K	Q	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		K	S	E	G	T	Q	P	E	G	T	Y	G	E	Q	L	V	P	E	L	C	N	Q	S	E	S	S	G	E	D	F	F	L	K	S	R	L	Q	E	Q	D	V	W	R	R	S	T	S	F	Y	T	H	M	C	N	P	W	V	S	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		G	A	V	G	S	L	L	I	M	F	V	I	Q	W	V	Y	T	L	V	N	M	G	V	A	A	I	V	Y	F	Y	I	G	R	A	S	P	G	L	H	L	G	S	A	S	N	F	S	F	F	R	W	M	R	S	L	L	L	P	S	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.
Sequence		R	S	L	R	S	P	Q	E	Q	I	I	L	A	P	S	L	A	K	V	D	M	E	M	T	Q	L	T	Q	E	N	A	D	F	A	T	R	D	R	Y	H	H	S	S	L	V	N	R	E	Q	L	M	P	H	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand