Job Description A0AV02 Confidence 97.30% Date Wed Jun 6 09:26:36 BST 2012 Rank 6 Aligned Residues 353 % Identity 12% Template d2a65a1 SCOP info SNF-like SNF-like SNF-like Resolution 1.65

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		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	P	W	W	K	T	Q	L	F	M	W	E	P	V	L	F	G	T	W	D	G	V	F	T	S	C	M	I	N	I	F	G	V	V	L	F	L	R	T	G	W	L	V	G	N	T	G	V	L	L	G	M	F	L	V	S	F	V	I	L	V	A	L	V	T	V	L	S	G	I	G	V	G	E	R	S	S	I	G	S
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Sequence		R	E	H	W	A	T	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	I	L	A	M	A	G	N	A	V	G	L	G	N	F	L	R	F	P	V	Q	A	A	E	N	G	.	G	G	A	F	M	I	P	Y	I	I	A	F	L	L	V	G	I	P	L	M	W	I	E	W	A	M	G	R	Y	G	G	A
Template Known Secondary structure						S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											S	S					T									T	T	.	T														T																	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.													.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.
		104				.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure			.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	.	.	.	G	V	Y	S	M	I	S	S	V	L	G	G	Q	T	G	G	T	I	G	L	L	Y	V	F	G	Q	C	V	A	G	A	M	Y	I	T	G	F	A	E	S	I	S	D	L	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	G	H	G	T	T	P	A	I	F	Y	L	L	W	R	N	R	F	A	K	I	L	G	V	F	G	L	W	I	P	L	V	V	A	I	Y	Y	V	Y	I	E	S	W	T	L	G	F	A	I	K	F	L	V	G	L	V	P	E	P	P	P	T	D	P	D	S	I	L	R	P	F	K	E	F	L	Y	S	Y	I	G
Template Known Secondary structure		T	T			S									S		S								T																														T																										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
										151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	N	I	W	A	V	R	G	I	S	V	A	V	L	L	A	L	L	G	I	N	L	A	G	V	K	W	I	I	R	L	Q	L	L	L	L	F	L	L	A	V	S	T	L	D	F	V	V	G	S	F	T	H	L	D	P	E	H	G	F	I	G	Y	S	P	E	L	L	Q	N	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	P	K	G	D	E	P	I	L	K	P	S	L	F	A	Y	I	V	F	L	I	T	M	F	I	N	V	S	I	L	I	R	G	I	S	K	G	I	E	R	F	A	K	I	A	M	P	T	L	F	I	L	A	V	F	L	V	I	R	V	F	L	L	E	T	P	N	G	T	A	A	D	G	L	N	F	L	W	T	P
Template Known Secondary structure				S	S	S	S		B																							T	T		T	T	T	T																								T	T				T	T												S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.		.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	L	P	D	Y	S	P	G	E	S	F	F	T	V	F	G	V	F	F	P	A	A	.	T	G	V	M	A	G	F	N	M	G	G	D	L	R	E	P	A	A	S	I	P	P	G	S	L	A	A	V	G	I	S	W	F	L	Y	I	I	F	V	F	L	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.											.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.
Template Sequence		D	F	E	K	L	K	D	P	G	V	W	I	A	A	V	G	Q	I	F	F	T	L	S	L	G	F	G	A	I	I	T	Y	A	.	S	Y	V	R	K	D	Q	D	I	V	L	S	G	L	T	A	A	T	L	N	E	K	A	E	V	I	L	G	G	S	I	S	I	P	A	A	V	A	F	F	G	V	A	N	A	V
Template Known Secondary structure			T	T	S	T	T																	T	T	T	S	S							.	T	T	S		T	T	S																			T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.
Template SS confidence
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
					288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	A	I	C	T	R	E	A	L	R	Y	D	F	L	I	A	E	K	V	S	L	M	G	F	L	F	L	L	G	L	Y	I	S	S	L	A	S	C	M	G	G	L	Y	G	A	P	R	I	L	Q	C	I	A	Q	E	K	V	I	P	A	L	A	C	L	G	Q	G	K	G	P	N	K	T	P	V	A	A	I
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																																								.			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	I	A	K	A	G	A	F	N	L	G	F	I	T	L	P	A	I	F	S	Q	T	A	G	G	T	F	L	G	F	L	W	F	F	L	L	F	F	A	G	L	T	S	S	I	A	I	M	Q	P	M	I	A	F	L	E	D	E	.	L	K	.	.	.	.	.	.	.	L	S	R	K	H	A	V	L	W	T	A	A
Template Known Secondary structure								S	S					T							T	T	S	T	T																																		T	.	S		.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																												.			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.								.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	L	T	S	L	V	T	M	A	F	V	F	V	G	Q	V	N	V	L	A	P	I	V	T	I	N	F	M	L	T	Y	V	A	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	V	F	F	S	A	H	L	V	M	F	L	N	K	S	L	D	E	M	D	F	W	A	G	T	I	G	V	V	F	F	G	L	T
Template Known Secondary structure													B	T	T									T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.