Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P20936 Date Fri May 25 10:08:08 BST 2012 Unique Job ID 1e22fc0a085ba97b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	M	A	A	E	A	G	S	E	E	G	G	P	V	T	A	G	A	G	G	G	G	A	A	A	G	S	S	A	Y	P	A	V	C	R	V	K	I	P	A	A	L	P	V	A	A	A	P	Y	P	G	L	V	E	T	G	V	A	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	G	G	G	A	A	L	G	S	E	F	L	G	A	G	S	V	A	G	A	L	G	G	A	G	L	T	G	G	G	T	A	A	G	V	A	G	A	A	A	G	V	A	G	A	A	V	A	G	P	S	G	D	M	A	L	T	K	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	S	L	L	A	E	T	L	G	P	G	G	G	F	P	P	L	P	P	P	P	Y	L	P	P	L	G	A	G	L	G	T	V	D	E	G	D	S	L	D	G	P	E	Y	E	E	E	E	V	A	I	P	L	T	A	P	P	T	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?						?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		W	Y	H	G	K	L	D	R	T	I	A	E	E	R	L	R	Q	A	G	K	S	G	S	Y	L	I	R	E	S	D	R	R	P	G	S	F	V	L	S	F	L	S	Q	M	N	V	V	N	H	F	R	I	I	A	M	C	G	D	Y	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	G	G	R	R	F	S	S	L	S	D	L	I	G	Y	Y	S	H	V	S	C	L	L	K	G	E	K	L	L	Y	P	V	A	P	P	E	P	V	E	D	R	R	R	V	R	A	I	L	P	Y	T	K	V	P	D	T	D	E	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	L	K	G	D	M	F	I	V	H	N	E	L	E	D	G	W	M	W	V	T	N	L	R	T	D	E	Q	G	L	I	V	E	D	L	V	E	E	V	G	R	E	E	D	P	H	E	G	K	I	W	F	H	G	K	I	S	K	Q	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	Y	N	L	L	M	T	V	G	Q	V	C	S	F	L	V	R	P	S	D	N	T	P	G	D	Y	S	L	Y	F	R	T	N	E	N	I	Q	R	F	K	I	C	P	T	P	N	N	Q	F	M	M	G	G	R	Y	Y	N	S	I	G
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Disorder											?
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Sequence		D	I	I	D	H	Y	R	K	E	Q	I	V	E	G	Y	Y	L	K	E	P	V	P	M	Q	D	Q	E	Q	V	L	N	D	T	V	D	G	K	E	I	Y	N	T	I	R	R	K	T	K	D	A	F	Y	K	N	I	V	K	K	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?		?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?		?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	L	K	K	G	K	G	K	R	W	K	N	L	Y	F	I	L	E	G	S	D	A	Q	L	I	Y	F	E	S	E	K	R	A	T	K	P	K	G	L	I	D	L	S	V	C	S	V	Y	V	V	H	D	S	L	F	G	R	P	N	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?												?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		F	Q	I	V	V	Q	H	F	S	E	E	H	Y	I	F	Y	F	A	G	E	T	P	E	Q	A	E	D	W	M	K	G	L	Q	A	F	C	N	L	R	K	S	S	P	G	T	S	N	K	R	L	R	Q	V	S	S	L	V	L	H	I
Secondary structure
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Disorder							?	?	?	?																															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		E	E	A	H	K	L	P	V	K	H	F	T	N	P	Y	C	N	I	Y	L	N	S	V	Q	V	A	K	T	H	A	R	E	G	Q	N	P	V	W	S	E	E	F	V	F	D	D	L	P	P	D	I	N	R	F	E	I	T	L	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?																	?	?				?																					?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		K	T	K	K	S	K	D	P	D	I	L	F	M	R	C	Q	L	S	R	L	Q	K	G	H	A	T	D	E	W	F	L	L	S	S	H	I	P	L	K	G	I	E	P	G	S	L	R	V	R	A	R	Y	S	M	E	K	I	M	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		E	E	Y	S	E	F	K	E	L	I	L	Q	K	E	L	H	V	V	Y	A	L	S	H	V	C	G	Q	D	R	T	L	L	A	S	I	L	L	R	I	F	L	H	E	K	L	E	S	L	L	L	C	T	L	N	D	R	E	I	S	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		E	D	E	A	T	T	L	F	R	A	T	T	L	A	S	T	L	M	E	Q	Y	M	K	A	T	A	T	Q	F	V	H	H	A	L	K	D	S	I	L	K	I	M	E	S	K	Q	S	C	E	L	S	P	S	K	L	E	K	N	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		V	N	T	N	L	T	H	L	L	N	I	L	S	E	L	V	E	K	I	F	M	A	S	E	I	L	P	P	T	L	R	Y	I	Y	G	C	L	Q	K	S	V	Q	H	K	W	P	T	N	T	T	M	R	T	R	V	V	S	G	F	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		F	L	R	L	I	C	P	A	I	L	N	P	R	M	F	N	I	I	S	D	S	P	S	P	I	A	A	R	T	L	I	L	V	A	K	S	V	Q	N	L	A	N	L	V	E	F	G	A	K	E	P	Y	M	E	G	V	N	P	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?					?														?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		K	S	N	K	H	R	M	I	M	F	L	D	E	L	G	N	V	P	E	L	P	D	T	T	E	H	S	R	T	D	L	S	R	D	L	A	A	L	H	E	I	C	V	A	H	S	D	E	L	R	T	L	S	N	E	R	G	A	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																				?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		H	V	L	K	K	L	L	A	I	T	E	L	L	Q	Q	K	Q	N	Q	Y	T	K	T	N	D	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?					?		?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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