Phyre 2 Results for A1L020

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	A1L020
Date	Tue Apr 3 15:04:20 BST 2012
Unique Job ID	1d9613f1f7c6b66e

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M P S L V V S G I M E R N G G F G E L G C F G G S A K D R G L L E D E R A L Q L A L D Q L C L L G L G E P P A P T A G E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence D G G G G G G G A P A Q P A A P P Q P A P P P P P A A P P A A P T A A P A A Q T P Q P P T A P K G A S D A K L C A L Y K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence E A E L R L K G S S N T T E C V P V P T S E H V A E I V G R Q G C K I K A L R A K T N T Y I K T P V R G E E P V F M V T

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?
? ? ?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence G R R E D V A T A R R E I I S A A E H F S M I R A S R N K S G A A F G V A P A L P G Q V T I R V R V P Y R V V G L V V G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence P K G A T I K R I Q Q Q T N T Y I I T P S R D R D P V F E I T G A P G N V E R A R E E I E T H I A V R T G K I L E Y N N

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence E N D F L A G S P D A A I D S R Y S D A W R V H Q P G C K P L S T F R Q N S L G C I G E C G V D S G F E A P R L G E Q G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence G D F G Y G G Y L F P G Y G V G K Q D V Y Y G V A E T S P P L W A G Q E N A T P T S V L F S S A S S S S S S S A K A R A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence G P P G A H R S P A T S A G P E L A G L P R R P P G E P L Q G F S K L G G G G L R S P G G G R D C M V C F E S E V T A A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ?
?
?
? ?
? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520

Sequence L V P C G H N L F C M E C A V R I C E R T D P E C P V C H I T A T Q A I R I F S

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
? ?
?
? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand